RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 TOMM70O94826 608 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 GNAI1P63096 354 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 PARP10Q53GL7 1025 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC93Q567U6 631 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 ANP32CO43423 234 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 HSPA6P17066 643 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 SOGA3Q5TF21 947 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 NLRP10Q86W26 655 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 SYNE4Q8N205 404 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 SNED1Q8TER0 1413 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 GLTPD2A6NH11 291 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP2-211ENST00000506932 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP2-211ENST00000506932 ALDH1B1P30837 517 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 TCIRG1Q13488 830 aa20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-211ENST00000506932 WDR90Q96KV7 1748 aa20.33■□□□□ 0.85
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SH3BP2-211ENST00000506932 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.33■□□□□ 0.85
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SH3BP2-211ENST00000506932 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP2-211ENST00000506932 POTECB2RU33 542 aa20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP2-211ENST00000506932 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP2-211ENST00000506932 COL4A5P29400 1685 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 WWC1Q8IX03 1113 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 TAF1P21675 1872 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC27Q2M243 656 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 NLRP3Q96P20 1036 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 ABCC4O15439 1325 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-211ENST00000506932 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP2-211ENST00000506932 PSMD1Q99460 953 aa20.25■□□□□ 0.83
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SH3BP2-211ENST00000506932 APLP1P51693 650 aa20.23■□□□□ 0.83
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SH3BP2-211ENST00000506932 MYD88Q99836 296 aa20.23■□□□□ 0.83
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SH3BP2-211ENST00000506932 POTEJP0CG39 1038 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-211ENST00000506932 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-211ENST00000506932 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-211ENST00000506932 IL16Q14005 1332 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-211ENST00000506932 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-211ENST00000506932 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-211ENST00000506932 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.21■□□□□ 0.83
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SH3BP2-211ENST00000506932 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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SH3BP2-211ENST00000506932 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-211ENST00000506932 G2E3Q7L622 706 aa20.19■□□□□ 0.82
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SH3BP2-211ENST00000506932 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-211ENST00000506932 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-211ENST00000506932 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-211ENST00000506932 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-211ENST00000506932 JDP2Q8WYK2 163 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-211ENST00000506932 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-211ENST00000506932 LTBP1Q14766 1721 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-211ENST00000506932 BBOX1O75936 387 aa20.17■□□□□ 0.82
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SH3BP2-211ENST00000506932 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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