RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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STRADB-210ENST00000498648 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 IFT43Q96FT9 208 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 SPON2Q9BUD6 331 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.69□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.69□□□□□ -1.34
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STRADB-210ENST00000498648 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 APPBP2Q92624 585 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 GINM1Q9NU53 330 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.65□□□□□ -1.34
STRADB-210ENST00000498648 TNFRSF21O75509 655 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 IL2RAP01589 272 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 CBLBQ13191 982 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 PWP1Q13610 501 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 TLR1Q15399 786 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 WBP1LQ9NX94 342 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.64□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.64□□□□□ -1.35
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STRADB-210ENST00000498648 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 BCO2Q9BYV7 579 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.63□□□□□ -1.35
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STRADB-210ENST00000498648 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.63□□□□□ -1.35
STRADB-210ENST00000498648 ESYT3A0FGR9 886 aa6.62□□□□□ -1.35
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