RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491658.1

TFRC-215, Transcript of transferrin receptor, humanhuman

TSL 5

Gene TFRC, Length 396 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFRC-215ENST00000491658 USTQ9Y2C2 406 aa7.37□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.36□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.36□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 SSFA2P28290 1259 aa7.36□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 ADH6P28332 368 aa7.36□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 INPP5BP32019 993 aa7.36□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 SPEM2Q0P670 501 aa7.36□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.36□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.36□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 TNFRSF10BO14763 440 aa7.35□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 MICAL2O94851 1124 aa7.35□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 EPXP11678 715 aa7.35□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 ARSDP51689 593 aa7.35□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 SYT9Q86SS6 491 aa7.35□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.35□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.35□□□□□ -1.23
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TFRC-215ENST00000491658 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 SCNN1AP37088 669 aa7.34□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 TREML1Q86YW5 311 aa7.34□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 SEPT3Q9UH03 358 aa7.34□□□□□ -1.23
TFRC-215ENST00000491658 SIN3BO75182 1162 aa7.33□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 FAM26DQ5JW98 314 aa7.33□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.33□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.33□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.33□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 OPLAHO14841 1288 aa7.32□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 RETREG2Q8NC44 543 aa7.32□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 MDFIQ99750 246 aa7.32□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 GSX2Q9BZM3 304 aa7.32□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 NEUROD1Q13562 356 aa7.31□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 TNFRSF25Q93038 417 aa7.31□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 BHMTQ93088 406 aa7.31□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 EFCC1Q9HA90 598 aa7.31□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 STIM2Q9P246 746 aa7.31□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.3□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 CCINQ13939 588 aa7.3□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.3□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 ELOA3Q8NG57 546 aa7.3□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 HELQQ8TDG4 1101 aa7.3□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 BTBD6Q96KE9 485 aa7.3□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.3□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 USP20Q9Y2K6 914 aa7.3□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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TFRC-215ENST00000491658 ABTB2Q8N961 1025 aa7.29□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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TFRC-215ENST00000491658 KCNMA1Q12791 1236 aa7.28□□□□□ -1.24
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TFRC-215ENST00000491658 CHSY3Q70JA7 882 aa7.28□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 PNMA5Q96PV4 448 aa7.28□□□□□ -1.24
TFRC-215ENST00000491658 ZBTB39O15060 712 aa7.27□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 EGFRP00533 1210 aa7.27□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 NFKB1P19838 968 aa7.27□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 ADH7P40394 386 aa7.27□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 GSK3AP49840 483 aa7.27□□□□□ -1.25
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TFRC-215ENST00000491658 PODNQ7Z5L7 613 aa7.27□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 MTMR7Q9Y216 660 aa7.27□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.27□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.27□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 ALAS2P22557 587 aa7.26□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 DGKGP49619 791 aa7.26□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 PDE4CQ08493 712 aa7.26□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.26□□□□□ -1.25
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TFRC-215ENST00000491658 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.26□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 ZFATQ9P243 1243 aa7.26□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.25□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 XYLBO75191 536 aa7.25□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 SASH3O75995 380 aa7.25□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 MAP3K6O95382 1288 aa7.25□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 GPR152Q8TDT2 470 aa7.25□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.25□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 RARAP10276 462 aa7.24□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 MPSTP25325 297 aa7.24□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 IRS1P35568 1242 aa7.24□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 MTMR3Q13615 1198 aa7.24□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 KANK3Q6NY19 840 aa7.24□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.24□□□□□ -1.25
TFRC-215ENST00000491658 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.24□□□□□ -1.25
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