RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ALDH1B1P30837 517 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 FSTL1Q12841 308 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 PARP10Q53GL7 1025 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 MBIPQ9NS73 344 aa36.31■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 CHPF2Q9P2E5 772 aa36.3■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 APLP1P51693 650 aa36.29■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP36.29■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa36.28■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 TAF1P21675 1872 aa36.28■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 SCN4AP35499 1836 aa36.27■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC10A5Q5PT55 438 aa36.27■■■■□ 3.4
HOXB3-211ENST00000490677 SLC51AQ86UW1 340 aa36.26■■■■□ 3.4
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HOXB3-211ENST00000490677 DPY19L2Q6NUT2 758 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-211ENST00000490677 RTKN2Q8IZC4 609 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-211ENST00000490677 COL4A5P29400 1685 aa36.25■■■■□ 3.39
HOXB3-211ENST00000490677 DUSP27Q5VZP5 1158 aa36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-211ENST00000490677 NLRP10Q86W26 655 aa36.24■■■■□ 3.39
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa36.24■■■■□ 3.39
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HOXB3-211ENST00000490677 CRAMP1Q96RY5 1269 aa36.23■■■■□ 3.39
HOXB3-211ENST00000490677 IFT57Q9NWB7 429 aa36.23■■■■□ 3.39
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HOXB3-211ENST00000490677 PSMD1Q99460 953 aa36.2■■■■□ 3.39
HOXB3-211ENST00000490677 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF541Q9H0D2 1346 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-211ENST00000490677 GNAI1P63096 354 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-211ENST00000490677 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa36.17■■■■□ 3.38
HOXB3-211ENST00000490677 PLBD2Q8NHP8 589 aa36.17■■■■□ 3.38
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HOXB3-211ENST00000490677 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa36.14■■■■□ 3.38
HOXB3-211ENST00000490677 ISCA1Q9BUE6 129 aa36.14■■■■□ 3.38
HOXB3-211ENST00000490677 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa36.14■■■■□ 3.38
HOXB3-211ENST00000490677 FZD9O00144 591 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXB3-211ENST00000490677 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
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HOXB3-211ENST00000490677 HYPKQ9NX55 129 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC37AA6NMS7 1700 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXB3-211ENST00000490677 ABCC4O15439 1325 aa36.12■■■■□ 3.37
HOXB3-211ENST00000490677 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
HOXB3-211ENST00000490677 C8orf58Q8NAV2 365 aa36.12■■■■□ 3.37
HOXB3-211ENST00000490677 SH3TC1Q8TE82 1336 aa36.11■■■■□ 3.37
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
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HOXB3-211ENST00000490677 ZNF428Q96B54 188 aa36.08■■■■□ 3.37
HOXB3-211ENST00000490677 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa36.08■■■■□ 3.37
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HOXB3-211ENST00000490677 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa36.06■■■■□ 3.36
HOXB3-211ENST00000490677 PCNTO95613 3336 aa36.06■■■■□ 3.36
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HOXB3-211ENST00000490677 IQCA1LA6NCM1 817 aa36.02■■■■□ 3.36
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HOXB3-211ENST00000490677 FAM89AQ96GI7 184 aa36.02■■■■□ 3.36
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HOXB3-211ENST00000490677 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
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HOXB3-211ENST00000490677 LARGE2Q8N3Y3 721 aa35.97■■■■□ 3.35
HOXB3-211ENST00000490677 JMYQ8N9B5 988 aa35.97■■■■□ 3.35
HOXB3-211ENST00000490677 HACL1Q9UJ83 578 aa35.96■■■■□ 3.35
HOXB3-211ENST00000490677 ANP32CO43423 234 aa35.95■■■■□ 3.35
HOXB3-211ENST00000490677 GOLGA2Q08379 1002 aa35.95■■■■□ 3.35
HOXB3-211ENST00000490677 RIC3Q7Z5B4 369 aa35.95■■■■□ 3.35
HOXB3-211ENST00000490677 LDHDQ86WU2 507 aa35.95■■■■□ 3.35
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