RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481600.5

EDRF1-208, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, human

TSL 2

Gene EDRF1, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDRF1-208	ENST00000481600	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	IP6K1	Q92551	441 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	SMC2	O95347	1197 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	MCM5	P33992	734 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	ME1	P48163	572 aa		13.77	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.77	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.77	□□□□□ -0.2
EDRF1-208	ENST00000481600	ANXA1	P04083	346 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	BEND3	Q5T5X7	828 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	AK2	P54819	239 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	STX6	O43752	255 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	NBPF4	Q96M43	638 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	IL25	Q9H293	177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	SPATA32	Q96LK8	384 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	KCNQ3	O43525	872 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	UBE2H	P62256	183 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	SYT1	P21579	422 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	TERF1	P54274	439 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	F13A1	P00488	732 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	STRN4	Q9NRL3	753 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	XBP1	P17861	261 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CABP4	P57796	275 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	TTC14	Q96N46	770 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CPA1	P15085	419 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	GJB2	P29033	226 aa		13.71	□□□□□ -0.21
EDRF1-208	ENST00000481600	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21

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