RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		30.93	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	30.93	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		30.92	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	NPHP1	O15259	732 aa		30.92	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	30.92	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	30.92	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	30.91	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	ST5	P78524	1137 aa		30.91	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	ALDH1L1	O75891	902 aa		30.9	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	TRIM27	P14373	513 aa		30.9	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		30.9	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		30.89	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	GCKR	Q14397	625 aa		30.89	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		30.89	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		30.89	■■■□□ 2.54
KCNS3-205	ENST00000481414	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		30.88	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	ERFE	Q4G0M1	354 aa		30.88	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		30.88	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	30.88	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	30.88	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		30.88	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	30.87	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		30.87	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	ABCC4	O15439	1325 aa		30.87	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	30.86	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM89A	Q96GI7	184 aa		30.85	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		30.84	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	ABCC12	Q96J65	1359 aa		30.84	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414		H7C1W4	665 aa		30.84	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	TGFB2	P61812	414 aa		30.84	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	30.84	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	KLHL34	Q8N239	644 aa		30.84	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		30.84	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	PDE6B	P35913	854 aa		30.83	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	SYNE4	Q8N205	404 aa		30.83	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	SYT17	Q9BSW7	474 aa		30.83	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		30.83	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	TNN	Q9UQP3	1299 aa		30.83	■■■□□ 2.53
KCNS3-205	ENST00000481414	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	30.82	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	30.82	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	MS4A1	P11836	297 aa		30.81	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	30.81	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		30.81	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		30.8	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	GRM8	O00222	908 aa		30.8	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	30.8	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	30.79	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	30.79	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	CASP7	P55210	303 aa		30.79	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	30.79	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	30.79	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		30.78	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	30.78	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	NLRP3	Q96P20	1036 aa		30.78	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	30.78	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	UTY	O14607	1347 aa		30.77	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	PLIN1	O60240	522 aa		30.77	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		30.77	■■■□□ 2.52
KCNS3-205	ENST00000481414		H0YIN7	160 aa		30.76	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	CRY2	Q49AN0	593 aa		30.76	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		30.76	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		30.76	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	USP44	Q9H0E7	712 aa		30.76	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	30.75	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	RLBP1	P12271	317 aa		30.75	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	DPEP1	P16444	411 aa		30.75	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		30.75	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A0G2JLW4	131 aa		30.74	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	CHRNA5	P30532	468 aa		30.74	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		30.74	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	PDE8A	O60658	829 aa		30.73	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	SRGN	P10124	158 aa		30.73	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	KCNA3	P22001	575 aa		30.73	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	PDE3A	Q14432	1141 aa		30.73	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		30.73	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	30.72	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	30.72	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		30.71	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	30.71	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	PANK1	Q8TE04	598 aa		30.71	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	MASTL	Q96GX5	879 aa		30.71	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	30.71	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	NPR1	P16066	1061 aa		30.7	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	STYK1	Q6J9G0	422 aa		30.7	■■■□□ 2.51
KCNS3-205	ENST00000481414	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	30.7	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	30.69	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	PIM2	Q9P1W9	311 aa		30.68	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	LAMB2	P55268	1798 aa		30.68	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		30.67	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	30.67	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	GNAI3	P08754	354 aa		30.66	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	CTSW	P56202	376 aa		30.66	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	30.66	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	MEIS3	Q99687	375 aa		30.66	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		30.66	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	30.65	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	FOXO4	P98177	505 aa		30.65	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		30.65	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		30.65	■■■□□ 2.5
KCNS3-205	ENST00000481414	CNKSR1	Q969H4	720 aa		30.65	■■■□□ 2.5

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