RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 G2E3Q7L622 706 aa26.93■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 CNKSR1Q969H4 720 aa26.93■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 NPR1P16066 1061 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 CRY2Q49AN0 593 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.91■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 E9PSI1 815 aa26.91■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 SLFN5Q08AF3 891 aa26.91■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 SYNE4Q8N205 404 aa26.9■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 KSR2Q6VAB6 950 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 ZNF428Q96B54 188 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 MYD88Q99836 296 aa26.89■■□□□ 1.9
ACTB-211ENST00000480301 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.88■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.87■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.87■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 C21orf2O43822 256 aa26.87■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.87■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.87■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 ADCY9O60503 1353 aa26.86■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 FLIIQ13045 1269 aa26.86■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.86■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 NLRP3Q96P20 1036 aa26.86■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 ALDH1B1P30837 517 aa26.85■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 SLX4Q8IY92 1834 aa26.85■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 FAM89AQ96GI7 184 aa26.84■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.83■■□□□ 1.89
ACTB-211ENST00000480301 NFKBIEO00221 500 aa26.82■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 RASSF7Q02833 373 aa26.82■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.82■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 IGKV5-2P06315 115 aa26.81■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 PRELPP51888 382 aa26.81■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.81■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 SOGA3Q5TF21 947 aa26.79■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 CACNA1FO60840 1977 aa26.78■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 OLFM4Q6UX06 510 aa26.78■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.77■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.77■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 RNF181Q9P0P0 153 aa26.77■■□□□ 1.88
ACTB-211ENST00000480301 CCDC93Q567U6 631 aa26.76■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 CACNA1SQ13698 1873 aa26.76■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.75■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 LMNB1P20700 586 aa26.75■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 ABCC4O15439 1325 aa26.74■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.74■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.74■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 SBF1O95248 1867 aa26.74■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.73■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 F6X3S4 739 aa26.73■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 LAMB2P55268 1798 aa26.72■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 SLC51AQ86UW1 340 aa26.72■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.72■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.71■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 LINS1Q8NG48 757 aa26.71■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 SNED1Q8TER0 1413 aa26.71■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.7■■□□□ 1.87
ACTB-211ENST00000480301 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.7■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 H7C1W4 665 aa26.69■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 BBOX1O75936 387 aa26.69■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.862e-6■■□□□ 13.5
ACTB-211ENST00000480301 GRAPQ13588 217 aa26.69■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 GCKRQ14397 625 aa26.69■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 BEND3Q5T5X7 828 aa26.69■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 PDE8AO60658 829 aa26.68■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.68■■□□□ 1.86
ACTB-211ENST00000480301 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms