RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477156.1

DGCR6-205, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, humanhuman

TSL 2

Gene DGCR6, Length 524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR6-205ENST00000477156 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.36■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.35■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 POTECB2RU33 542 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 IFT57Q9NWB7 429 aa23.34■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 FSTL1Q12841 308 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
DGCR6-205ENST00000477156 TCIRG1Q13488 830 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.32■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 TAF1P21675 1872 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 APLP1P51693 650 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 GNAI1P63096 354 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 NLRP10Q86W26 655 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.3■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 SCN4AP35499 1836 aa23.29■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.29■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.28■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.28■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 SYNE4Q8N205 404 aa23.28■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.28■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 NLRP3Q96P20 1036 aa23.28■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 PSMD1Q99460 953 aa23.27■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 HYPKQ9NX55 129 aa23.27■■□□□ 1.32
DGCR6-205ENST00000477156 SLC51AQ86UW1 340 aa23.26■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.26■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.25■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.25■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 CCDC27Q2M243 656 aa23.24■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 COL4A5P29400 1685 aa23.24■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.23■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.23■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.23■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 FZD9O00144 591 aa23.22■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 ABCC4O15439 1325 aa23.22■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 WWC1Q8IX03 1113 aa23.21■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 MRS2Q9HD23 443 aa23.21■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 CACNA1FO60840 1977 aa23.21■■□□□ 1.31
DGCR6-205ENST00000477156 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.2■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 ANP32CO43423 234 aa23.2■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 TSPYL6Q8N831 410 aa23.2■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 ZNF428Q96B54 188 aa23.2■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.2■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 HTRA3P83110 453 aa23.19■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 BBOX1O75936 387 aa23.17■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 POTEIP0CG38 1075 aa23.17■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 POTEJP0CG39 1038 aa23.17■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 JDP2Q8WYK2 163 aa23.17■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 FAM89AQ96GI7 184 aa23.17■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.16■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.16■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.16■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.16■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 SP8Q8IXZ3 490 aa23.16■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.15■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 GOLGA2Q08379 1002 aa23.15■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 GRAPQ13588 217 aa23.15■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 IL16Q14005 1332 aa23.14■■□□□ 1.3
DGCR6-205ENST00000477156 COL4A1P02462 1669 aa23.14■■□□□ 1.29
DGCR6-205ENST00000477156 CHADLQ6NUI6 762 aa23.14■■□□□ 1.29
DGCR6-205ENST00000477156 GPC2Q8N158 579 aa23.14■■□□□ 1.29
DGCR6-205ENST00000477156 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.14■■□□□ 1.29
DGCR6-205ENST00000477156 PCNTO95613 3336 aa23.13■■□□□ 1.29
DGCR6-205ENST00000477156 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.13■■□□□ 1.29
DGCR6-205ENST00000477156 KLRG1Q96E93 195 aa23.13■■□□□ 1.29
DGCR6-205ENST00000477156 VPS33BQ9H267 617 aa23.13■■□□□ 1.29
DGCR6-205ENST00000477156 LTBP1Q14766 1721 aa23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms