RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475790.5

MEGF6-204, Transcript of multiple EGF like domains 6, human

TSL 3

Gene MEGF6, Length 883 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF6-204	ENST00000475790	GLTPD2	A6NH11	291 aa		28.01	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	ALDH1B1	P30837	517 aa		28	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	GNAI1	P63096	354 aa		28	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	LAMB2	P55268	1798 aa		28	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		27.99	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	ANP32C	O43423	234 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	MRS2	Q9HD23	443 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	WDR90	Q96KV7	1748 aa		27.97	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	TCIRG1	Q13488	830 aa		27.96	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	NLRP10	Q86W26	655 aa		27.96	■■■□□ 2.07
MEGF6-204	ENST00000475790	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	27.95	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	SNED1	Q8TER0	1413 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		27.94	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	HYPK	Q9NX55	129 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	SYNE4	Q8N205	404 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	ZNF428	Q96B54	188 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	NLRP3	Q96P20	1036 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	SLC51A	Q86UW1	340 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	POTEC	B2RU33	542 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
MEGF6-204	ENST00000475790	TAF1	P21675	1872 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	FSTL1	Q12841	308 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	CCDC27	Q2M243	656 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	WWC1	Q8IX03	1113 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	PSMD1	Q99460	953 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	APLP1	P51693	650 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	TSPYL6	Q8N831	410 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	ABCC4	O15439	1325 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	COL4A5	P29400	1685 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	GOLGA2	Q08379	1002 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MEGF6-204	ENST00000475790	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	SCN4A	P35499	1836 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	FAM89A	Q96GI7	184 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	IL16	Q14005	1332 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	FZD9	O00144	591 aa		27.79	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	HTRA3	P83110	453 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	MYD88	Q99836	296 aa		27.77	■■■□□ 2.04
MEGF6-204	ENST00000475790	BBOX1	O75936	387 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	GRAP	Q13588	217 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	JDP2	Q8WYK2	163 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		27.76	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	COL4A1	P02462	1669 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	POTEI	P0CG38	1075 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	POTEJ	P0CG39	1038 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		27.75	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	SP8	Q8IXZ3	490 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		27.74	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		27.73	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
MEGF6-204	ENST00000475790	AOC3	Q16853	763 aa		27.72	■■■□□ 2.03

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