RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475330.1

CBX1P5-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P5, Length 559 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P5-201ENST00000475330 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.77□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 USP3Q9Y6I4 520 aa8.77□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 SPINT1O43278 529 aa8.76□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 BMP2P12643 396 aa8.76□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.76□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.76□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 ABL1P00519 1130 aa8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 AVPP01185 164 aa8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 GPC1P35052 558 aa8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 PKDCCQ504Y2 493 aa8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 COL26A1Q96A83 441 aa8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 SEPT3Q9UH03 358 aa8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 PREX2Q70Z35 1606 aa8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 CPS1P31327 1500 aa8.75□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.74□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.74□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 GFRA3O60609 400 aa8.74□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.74□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.74□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 DGAT1O75907 488 aa8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 GNASQ5JWF2 1037 aa8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 CABP1Q9NZU7 370 aa8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.73□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 SERTM1A2A2V5 107 aa8.72□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.72□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 BMP1P13497 986 aa8.72□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 SCARF1Q14162 830 aa8.72□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 TEAD4Q15561 434 aa8.72□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.72□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 PLXNC1O60486 1568 aa8.72□□□□□ -1.01
CBX1P5-201ENST00000475330 EML1O00423 815 aa8.71□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 POTEAQ6S8J7 498 aa8.71□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 CLIP1P30622 1438 aa8.71□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 FMN1Q68DA7 1419 aa8.71□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 H3BRB1 525 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 AXIN1O15169 862 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 NOS2P35228 1153 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 GGT6Q6P531 493 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 PLA2G4AP47712 749 aa8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 LAPTM4AQ15012 233 aa8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 CCDC27Q2M243 656 aa8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 C16orf46Q6P387 395 aa8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 RNF217Q8TC41 542 aa8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 HELQQ8TDG4 1101 aa8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 NGLY1Q96IV0 654 aa8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 A2MP01023 1474 aa8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.69□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 ICMTO60725 284 aa8.68□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 MTMR3Q13615 1198 aa8.68□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 C4orf17Q53FE4 359 aa8.68□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.68□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.68□□□□□ -1.02
CBX1P5-201ENST00000475330 ATP7AQ04656 1500 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms