RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470287.1

FUBP1-205, Transcript of far upstream element binding protein 1, human

TSL 3

Gene FUBP1, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FUBP1-205	ENST00000470287	SBNO1	A3KN83	1393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	PEAK1	Q9H792	1746 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	TRIM37	O94972	964 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	DLL1	O00548	723 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	ITGA6	P23229	1130 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	NBPF11	Q86T75	865 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	ITPKC	Q96DU7	683 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	ATP7B	P35670	1465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	DLC1	Q96QB1	1528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	MYOM1	P52179	1685 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	ARHGEF10	O15013	1369 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	PSME1	Q06323	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	CHD4	Q14839	1912 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	COL26A1	Q96A83	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FUBP1-205	ENST00000470287	COL18A1	P39060	1754 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	MEIOB	Q8N635	442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	SIRT1	Q96EB6	747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	STRN4	Q9NRL3	753 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	APBA3	O96018	575 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	BCR	P11274	1271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	JUND	P17535	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	ITSN1	Q15811	1721 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68	1e-9	■□□□□ 9.6
FUBP1-205	ENST00000470287	SULF1	Q8IWU6	871 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	GAS6	Q14393	721 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	POGK	Q9P215	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	USP19	O94966	1318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	ACE	P12821	1306 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	SPTLC1	O15269	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	KCNQ2	O43526	872 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	HSPA6	P17066	643 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-205	ENST00000470287	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms