RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468747.5

FAM107B-211, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM107B, Length 2,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM107B-211ENST00000468747 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.73■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.73■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 GJB2P29033 226 aa26.73■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 POLA2Q14181 598 aa26.73■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.73■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 HYPKQ9NX55 129 aa26.73■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 MTMR6Q9Y217 621 aa26.73■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 SRGAP3O43295 1099 aa26.72■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 HSPA2P54652 639 aa26.72■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 SPC24Q8NBT2 197 aa26.72■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.72■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 RAB11FIP3O75154 756 aa26.71■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 CHRNA2Q15822 529 aa26.71■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.71■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 KIF3AQ9Y496 699 aa26.71■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.71■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 PTH1RQ03431 593 aa26.7■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 CNTROBQ8N137 903 aa26.7■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 KIAA1524Q8TCG1 905 aa26.7■■□□□ 1.87
FAM107B-211ENST00000468747 SLC39A6Q13433 755 aa26.7■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 ST3GAL1Q11201 340 aa26.69■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.69■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.69■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.69■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.68■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.68■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.68■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 CBX1P83916 185 aa26.68■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 ATP2B3Q16720 1220 aa26.67■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.67■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 DCCP43146 1447 aa26.67■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 KSR2Q6VAB6 950 aa26.67■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 NECAB1Q8N987 351 aa26.67■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.66■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.66■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 PHKG2P15735 406 aa26.66■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF790Q6PG37 636 aa26.65■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.65■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.65■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 MEGF6O75095 1541 aa26.64■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 ME3Q16798 604 aa26.64■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.64■■□□□ 1.86
FAM107B-211ENST00000468747 PDIA6Q15084 440 aa26.63■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.63■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.63■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 CAMK4Q16566 473 aa26.63■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 FERMT3Q86UX7 667 aa26.63■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.62■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 VPS53Q5VIR6 699 aa26.62■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 TTC6Q86TZ1 520 aa26.62■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 ALDH1L1O75891 902 aa26.62■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.61■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 CCDC192P0DO97 292 aa26.61■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 LIG1P18858 919 aa26.61■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 DMTNQ08495 405 aa26.61■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.61■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.61■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 PTGS1P23219 599 aa26.6■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.6■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.6■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.6■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 LUZP1Q86V48 1076 aa26.59■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.59■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 CYP27B1O15528 508 aa26.59■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.59■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.859e-7■■■□□ 15.2
FAM107B-211ENST00000468747 COL18A1P39060 1754 aa26.59■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.58■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.58■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 MTX1Q13505 466 aa26.58■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
FAM107B-211ENST00000468747 MYL6BP14649 208 aa26.57■■□□□ 1.84
FAM107B-211ENST00000468747 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.57■■□□□ 1.84
FAM107B-211ENST00000468747 LINS1Q8NG48 757 aa26.57■■□□□ 1.84
FAM107B-211ENST00000468747 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.57■■□□□ 1.84
FAM107B-211ENST00000468747 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
FAM107B-211ENST00000468747 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
FAM107B-211ENST00000468747 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
FAM107B-211ENST00000468747 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
FAM107B-211ENST00000468747 PDCL2Q8N4E4 241 aa26.56■■□□□ 1.84
FAM107B-211ENST00000468747 TYRO3Q06418 890 aa26.56■■□□□ 1.84
FAM107B-211ENST00000468747 NECTIN1Q15223 517 aa26.56■■□□□ 1.84
FAM107B-211ENST00000468747 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 567.5 ms