RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 ARHGAP45Q92619 1136 aa11.21□□□□□ -0.61
CASQ1-202ENST00000467691 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CASQ1-202ENST00000467691 NYXQ9GZU5 481 aa11.21□□□□□ -0.61
CASQ1-202ENST00000467691 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CASQ1-202ENST00000467691 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CASQ1-202ENST00000467691 TNNQ9UQP3 1299 aa11.21□□□□□ -0.61
CASQ1-202ENST00000467691 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 LRP5O75197 1615 aa11.2□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 ST5P78524 1137 aa11.2□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 ERFEQ4G0M1 354 aa11.2□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.2□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11.2□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.2□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.19□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 PLIN1O60240 522 aa11.19□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 SYNE4Q8N205 404 aa11.19□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 FAM89AQ96GI7 184 aa11.19□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.18□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 ABCC12Q96J65 1359 aa11.18□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 ABCC4O15439 1325 aa11.18□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.18□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 GCKRQ14397 625 aa11.18□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.18□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 ALDH1L1O75891 902 aa11.17□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.17□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 BRIP1Q9BX63 1249 aa11.17□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.17□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.16□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 RLBP1P12271 317 aa11.16□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM57Q8N5G2 664 aa11.16□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.16□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 PANK1Q8TE04 598 aa11.16□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 SYT17Q9BSW7 474 aa11.16□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 A0A0G2JLW4 131 aa11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 H7C1W4 665 aa11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 GRM8O00222 908 aa11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 CHRNA5P30532 468 aa11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 PDE6BP35913 854 aa11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 RRP1P56182 461 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 ITPRIPQ8IWB1 547 aa11.15□□□□□ -0.62
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa11.15□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.14□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 MS4A1P11836 297 aa11.14□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 DPEP1P16444 411 aa11.14□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 CASP7P55210 303 aa11.14□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 TGFB2P61812 414 aa11.14□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 C20orf194Q5TEA3 1177 aa11.14□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 NLRP3Q96P20 1036 aa11.14□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.14□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.13□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.13□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 H0YIN7 160 aa11.13□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 USP44Q9H0E7 712 aa11.13□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 PDE8AO60658 829 aa11.12□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 SRGNP10124 158 aa11.12□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 SUCLG2Q96I99 432 aa11.12□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 MEIS3Q99687 375 aa11.12□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 COG6Q9Y2V7 657 aa11.12□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.12□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 UTYO14607 1347 aa11.11□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 LAMB2P55268 1798 aa11.11□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 NPR1P16066 1061 aa11.11□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 KCNA3P22001 575 aa11.11□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 CTSWP56202 376 aa11.11□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 PDE3AQ14432 1141 aa11.11□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 CRY2Q49AN0 593 aa11.11□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.11□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 MASTLQ96GX5 879 aa11.11□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.11□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 GNAI3P08754 354 aa11.1□□□□□ -0.63
CASQ1-202ENST00000467691 FOXO4P98177 505 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms