RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 ALDH1B1P30837 517 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 NLRP10Q86W26 655 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 COL4A5P29400 1685 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 CACNA1SQ13698 1873 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 TCIRG1Q13488 830 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 SYNE4Q8N205 404 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 IFT57Q9NWB7 429 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 HTRA3P83110 453 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 SMC1BQ8NDV3 1235 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 PSMD1Q99460 953 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTPRF-211ENST00000467464 FZD9O00144 591 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 POTEIP0CG38 1075 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 POTEJP0CG39 1038 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 GNAI1P63096 354 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 NLRP3Q96P20 1036 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 ABCC4O15439 1325 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 SH3TC1Q8TE82 1336 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 HYPKQ9NX55 129 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC27Q2M243 656 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 TSPYL6Q8N831 410 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF428Q96B54 188 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 KLRG1Q96E93 195 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 COL4A1P02462 1669 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 LAMB2P55268 1798 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 WWC1Q8IX03 1113 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 JMYQ8N9B5 988 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRF-211ENST00000467464 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 IQCA1LA6NCM1 817 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 GRAPQ13588 217 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 CHADLQ6NUI6 762 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 FAM89AQ96GI7 184 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 BBOX1O75936 387 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 LDHDQ86WU2 507 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 SP8Q8IXZ3 490 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 GPC2Q8N158 579 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 LTBP1Q14766 1721 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 PASKQ96RG2 1323 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 AOC3Q16853 763 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 JDP2Q8WYK2 163 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 VPS33BQ9H267 617 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 MRS2Q9HD23 443 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 HACL1Q9UJ83 578 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 EPHX2P34913 555 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 SCNN1DP51172 638 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 GOLGA2Q08379 1002 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRF-211ENST00000467464 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
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