RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	RIPK4	P57078	832 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	RGL2	O15211	777 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	A1BG	P04217	495 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	FZD9	O00144	591 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	CA12	O43570	354 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	GRM1	Q13255	1194 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	PSMD1	Q99460	953 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-223	ENST00000466245	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	CHL1	O00533	1208 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	MAP2K2	P36507	400 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	APAF1	O14727	1248 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	HOXB7	P09629	217 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	RGS19	P49795	217 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	IL16	Q14005	1332 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	NUP98	P52948	1817 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TTLL3-223	ENST00000466245	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	GNAI1	P63096	354 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	PPIP5K2	O43314	1243 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	EPS15	P42566	896 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	SCNN1D	P51172	638 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	VPS33B	Q9H267	617 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	DGKZ	Q13574	1117 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	PDIA6	Q15084	440 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	TRAF5	O00463	557 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	AOC2	O75106	756 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-223	ENST00000466245	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.05	□□□□□ -0.32

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