RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466015.1

EHD1-208, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 1,290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-208ENST00000466015 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.43■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 LMNB1P20700 586 aa24.43■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 NLRP3Q96P20 1036 aa24.43■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.43■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.42■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.42■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 NUP98P52948 1817 aa24.42■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.41■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 NFKBIEO00221 500 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 CRY2Q49AN0 593 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 ZNF428Q96B54 188 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.4■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.39■■□□□ 1.5
EHD1-208ENST00000466015 CCER2I3L3R5 266 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 CCDC93Q567U6 631 aa24.39■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.38■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.37■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 SLC4A2P04920 1241 aa24.36■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 MYD88Q99836 296 aa24.36■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.35■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 SYNE4Q8N205 404 aa24.34■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.34■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.34■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 FAM89AQ96GI7 184 aa24.33■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.33■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
EHD1-208ENST00000466015 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.33■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 C1QTNF8P60827 252 aa24.32■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.32■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 KSR2Q6VAB6 950 aa24.32■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 VAMP4O75379 141 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 PRELPP51888 382 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 OLFM4Q6UX06 510 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.31■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.3■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 SLX4Q8IY92 1834 aa24.3■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.29■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 FLIIQ13045 1269 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 G2E3Q7L622 706 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.28■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 BBOX1O75936 387 aa24.27■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 ABCC4O15439 1325 aa24.27■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 ZNF521Q96K83 1311 aa24.27■■□□□ 1.48
EHD1-208ENST00000466015 E9PSI1 815 aa24.26■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 GLTPD2A6NH11 291 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 KIF3CO14782 793 aa24.25■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 GRAPQ13588 217 aa24.24■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 RRAGCQ9HB90 399 aa24.24■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.24■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 CACNA1SQ13698 1873 aa24.24■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 PSMD1Q99460 953 aa24.23■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 TMC4Q7Z404 712 aa24.21■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 MIER1Q8N108 512 aa24.21■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.21■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 JDP2Q8WYK2 163 aa24.21■■□□□ 1.47
EHD1-208ENST00000466015 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.2■■□□□ 1.46
EHD1-208ENST00000466015 TOMM70O94826 608 aa24.2■■□□□ 1.46
EHD1-208ENST00000466015 IGKV5-2P06315 115 aa24.2■■□□□ 1.46
EHD1-208ENST00000466015 SP8Q8IXZ3 490 aa24.2■■□□□ 1.46
EHD1-208ENST00000466015 SBF1O95248 1867 aa24.19■■□□□ 1.46
EHD1-208ENST00000466015 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.19■■□□□ 1.46
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