RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 LAMC2Q13753 1193 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM129BQ96TA1 746 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 NEFLP07196 543 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 ITGA6P23229 1130 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 TMC7Q7Z402 723 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 KLRG1Q96E93 195 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNQ4P56696 695 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 FGD1P98174 961 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 BRD7Q9NPI1 651 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 TREHO43280 583 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 PLCB3Q01970 1234 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 PHF24Q9UPV7 400 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 DBN1Q16643 649 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 C8orf34Q49A92 452 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 XKR5Q6UX68 686 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 EFSO43281 561 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 EGFRP00533 1210 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 BCL11AQ9H165 835 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 EFCC1Q9HA90 598 aa9.5□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 PPFIA3O75145 1194 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 TNP2Q05952 138 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 DSC3Q14574 896 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 IGHA2P01877 340 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 THBS1P07996 1170 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 LCE2BO14633 110 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR182O15218 404 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 XYLBO75191 536 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 MARK1Q9P0L2 795 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGGTB-205ENST00000462042 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 BNIP3LO60238 219 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 SV2AQ7L0J3 742 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ITGAEP38570 1179 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP2B2Q01814 1243 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CCINQ13939 588 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM182BQ5T319 152 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 NLRP13Q86W25 1043 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ELP3Q9H9T3 547 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 USP20Q9Y2K6 914 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 NEUROD1Q13562 356 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 GIPC2Q8TF65 315 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 PMEPA1Q969W9 287 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CDC14CA4D256 554 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 MAPK8P45983 427 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 TNFRSF21O75509 655 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 FGFR3P22607 806 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 FBF1Q8TES7 1133 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 PNMA5Q96PV4 448 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 CSRNP1Q96S65 589 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 GSX2Q9BZM3 304 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms