RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 KRBA1A5PL33 1030 aa8.78□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.78□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 TNFRSF25Q93038 417 aa8.78□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.77□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 MSTNO14793 375 aa8.77□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXO3O43524 673 aa8.77□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 IER5Q5VY09 327 aa8.77□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.77□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ZMYND15Q9H091 742 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 BCS1LQ9Y276 419 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 BHMTQ93088 406 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 KLK14Q9P0G3 267 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ADH7P40394 386 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 DGKZQ13574 1117 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM11Q96F44 468 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 PROCP04070 461 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 PLVAPQ9BX97 442 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 M0R082 166 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 MYO19Q96H55 970 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 EFCC1Q9HA90 598 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 ALBP02768 609 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 EPB42P16452 691 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 IDH3AP50213 366 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 GSX2Q9BZM3 304 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
RABGGTB-204ENST00000461653 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 STK32AQ8WU08 396 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 PNMA5Q96PV4 448 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.026e-6■□□□□ 11
RABGGTB-204ENST00000461653 PRMT3O60678 531 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 INPP5BP32019 993 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 CCINQ13939 588 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 IGFLR1Q9H665 355 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 ARSDP51689 593 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 MICAL2O94851 1124 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 NFKB1P19838 968 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 ATG7O95352 703 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 CD163Q86VB7 1156 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 CHRNA4P43681 627 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 OCLNQ16625 522 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 IFT43Q96FT9 208 aa8.67□□□□□ -1.02
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RABGGTB-204ENST00000461653 BAG6P46379 1132 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 COX20Q5RI15 118 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-204ENST00000461653 NID1P14543 1247 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 ARID3CA6NKF2 412 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 LILRB5O75023 590 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 TREML1Q86YW5 311 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM229AH3BQW9 127 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 OPLAHO14841 1288 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 NUDT8Q8WV74 236 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 ZFATQ9P243 1243 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 NAGPAQ9UK23 515 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 USP20Q9Y2K6 914 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP3K6O95382 1288 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 PCSK7Q16549 785 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 C16orf46Q6P387 395 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 HOMEZQ8IX15 550 aa8.63□□□□□ -1.03
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