RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-208	ENST00000461648	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	ST5	P78524	1137 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	ERFE	Q4G0M1	354 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TSC2-208	ENST00000461648	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	TRIM27	P14373	513 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	ABCC12	Q96J65	1359 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	ALDH1L1	O75891	902 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	GCKR	Q14397	625 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	FAM89A	Q96GI7	184 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	ABCC4	O15439	1325 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	SYNE4	Q8N205	404 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	TNN	Q9UQP3	1299 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	SYT17	Q9BSW7	474 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TSC2-208	ENST00000461648	PDE6B	P35913	854 aa		32.26	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	TGFB2	P61812	414 aa		32.26	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	LAMB2	P55268	1798 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648		H7C1W4	665 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	GRM8	O00222	908 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648		A0A0G2JLW4	131 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	PLIN1	O60240	522 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	DPEP1	P16444	411 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	CHRNA5	P30532	468 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	CASP7	P55210	303 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648	NLRP3	Q96P20	1036 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TSC2-208	ENST00000461648		H0YIN7	160 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	MS4A1	P11836	297 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	PDE8A	O60658	829 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	RLBP1	P12271	317 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	UTY	O14607	1347 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	MYH3	P11055	1940 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	SRGN	P10124	158 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	KCNA3	P22001	575 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	CRY2	Q49AN0	593 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	USP44	Q9H0E7	712 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	PANK1	Q8TE04	598 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TSC2-208	ENST00000461648	MASTL	Q96GX5	879 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	NPR1	P16066	1061 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	STYK1	Q6J9G0	422 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	32.12	■■■□□ 2.73	8e-6	■■□□□ 11.7
TSC2-208	ENST00000461648	PIM2	Q9P1W9	311 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	PDE3A	Q14432	1141 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	CTSW	P56202	376 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	CACNA1S	Q13698	1873 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	SUCLG2	Q96I99	432 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TSC2-208	ENST00000461648	MEIS3	Q99687	375 aa		32.08	■■■□□ 2.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.6 ms