RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	HSPA2	P54652	639 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT32	Q14532	448 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A087WZG4	1122 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP5J	P18859	108 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNB2	Q92953	911 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	SASH1	O94885	1247 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	STARD3NL	O95772	234 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	SSFA2	P28290	1259 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNJ4	P48050	445 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	NUP98	P52948	1817 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	TCHH	Q07283	1943 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758		H7C1W4	665 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	CIAO1	O76071	339 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	PHF14	O94880	888 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	BRD1	O95696	1058 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	PDC	P20941	246 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	JCAD	Q9P266	1359 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	CASP7	P55210	303 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF445	P59923	1031 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC14	Q96N46	770 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	HAUS7	Q99871	368 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	MED23	Q9ULK4	1368 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-222	ENST00000459758	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	LAMB2	P55268	1798 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	SIL1	Q9H173	461 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	STRN4	Q9NRL3	753 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-222	ENST00000459758	NRAP	Q86VF7	1730 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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