RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPN22Q9Y2R2 807 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF333Q96JL9 665 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRC1P22897 1456 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NR2E3Q9Y5X4 410 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNED1Q8TER0 1413 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSMD1Q99460 953 aa12.4□□□□□ -0.42
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EYSQ5T1H1 3165 aa12.4□□□□□ -0.42
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DLK2Q6UY11 383 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL15A1P39059 1388 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OLFM4Q6UX06 510 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.39□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.39□□□□□ -0.43
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRIT3Q3SXY7 679 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDHR2Q9BYE9 1310 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NCAPD2Q15021 1401 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa12.37□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HTATIP2Q9BUP3 242 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.36□□□□□ -0.43
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRPM4Q8TD43 1214 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TONSLQ96HA7 1378 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF609O15014 1411 aa12.36□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GUCD1Q96NT3 240 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STAP2Q9UGK3 403 aa12.35□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPR1P16066 1061 aa12.34□□□□□ -0.43
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BMP8BP34820 402 aa12.34□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBC1D9BQ66K14 1250 aa12.34□□□□□ -0.43
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT26Q7Z3Y9 468 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NBPF11Q86T75 865 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LARGE2Q8N3Y3 721 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNBD1Q8NA66 436 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ST5P78524 1137 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERO1AQ96HE7 468 aa12.32□□□□□ -0.44
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa12.32□□□□□ -0.44
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa12.31□□□□□ -0.44
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.29□□□□□ -0.44
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CABP4P57796 275 aa12.27□□□□□ -0.45
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POTEB2H3BUK9 544 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALDH1B1P30837 517 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRIPAP1Q4V328 841 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H7C1D1 291 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FLT4P35916 1363 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF24Q5T7B8 1368 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDCA5Q96FF9 252 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A087WZG4 1122 aa12.24□□□□□ -0.45
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