RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
TRIOBP-209ENST00000428075 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP36.44■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 PARP10Q53GL7 1025 aa36.44■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 MBIPQ9NS73 344 aa36.44■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 CHPF2Q9P2E5 772 aa36.44■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 DPY19L2Q6NUT2 758 aa36.43■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC51AQ86UW1 340 aa36.43■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa36.42■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa36.42■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 HOXB7P09629 217 aa36.41■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 RTKN2Q8IZC4 609 aa36.41■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC10A5Q5PT55 438 aa36.4■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa36.4■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 DDNO94850 711 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 DUSP27Q5VZP5 1158 aa36.39■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 NLRP10Q86W26 655 aa36.39■■■■□ 3.42
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa36.38■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 TCIRG1Q13488 830 aa36.38■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 SMC1BQ8NDV3 1235 aa36.38■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 HTRA3P83110 453 aa36.37■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 SYNE4Q8N205 404 aa36.37■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 CRAMP1Q96RY5 1269 aa36.37■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa36.34■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 IFT57Q9NWB7 429 aa36.34■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 PSMD1Q99460 953 aa36.33■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF541Q9H0D2 1346 aa36.33■■■■□ 3.41
TRIOBP-209ENST00000428075 IARSP41252 1262 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 NLRP3Q96P20 1036 aa36.32■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 PLBD2Q8NHP8 589 aa36.31■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 RNF123Q5XPI4 1314 aa36.31■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 COL4A5P29400 1685 aa36.3■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa36.3■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF428Q96B54 188 aa36.3■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 GNAI1P63096 354 aa36.29■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa36.29■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 LAMB2P55268 1798 aa36.27■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 FZD9O00144 591 aa36.27■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 POTEIP0CG38 1075 aa36.27■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 POTEJP0CG39 1038 aa36.27■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ISCA1Q9BUE6 129 aa36.27■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 HYPKQ9NX55 129 aa36.27■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 C8orf58Q8NAV2 365 aa36.26■■■■□ 3.4
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCC4O15439 1325 aa36.26■■■■□ 3.39
TRIOBP-209ENST00000428075 SH3TC1Q8TE82 1336 aa36.24■■■■□ 3.39
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa36.22■■■■□ 3.39
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa36.22■■■■□ 3.39
TRIOBP-209ENST00000428075 GRIPAP1Q4V328 841 aa36.21■■■■□ 3.39
TRIOBP-209ENST00000428075 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
TRIOBP-209ENST00000428075 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
TRIOBP-209ENST00000428075 KLRG1Q96E93 195 aa36.19■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 SCN4AP35499 1836 aa36.19■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 TSPYL6Q8N831 410 aa36.18■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 IQCA1LA6NCM1 817 aa36.17■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 CHADLQ6NUI6 762 aa36.17■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM89AQ96GI7 184 aa36.17■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 TAF1P21675 1872 aa36.16■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 BBOX1O75936 387 aa36.16■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC27Q2M243 656 aa36.16■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 JDP2Q8WYK2 163 aa36.16■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 WWC1Q8IX03 1113 aa36.15■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 SP8Q8IXZ3 490 aa36.14■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 GPC2Q8N158 579 aa36.14■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
TRIOBP-209ENST00000428075 GRAPQ13588 217 aa36.13■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 LARGE2Q8N3Y3 721 aa36.13■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 MRS2Q9HD23 443 aa36.13■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 HACL1Q9UJ83 578 aa36.12■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 RIC3Q7Z5B4 369 aa36.11■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 JMYQ8N9B5 988 aa36.11■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 COL4A1P02462 1669 aa36.1■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 GOLGA2Q08379 1002 aa36.1■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 AOC3Q16853 763 aa36.1■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 LDHDQ86WU2 507 aa36.1■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 EPHX2P34913 555 aa36.09■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa36.09■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 PPIP5K2O43314 1243 aa36.08■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 ANP32CO43423 234 aa36.08■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 EIF6P56537 245 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
TRIOBP-209ENST00000428075 LTBP1Q14766 1721 aa36.08■■■■□ 3.37
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