RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.76■□□□□ 0.27
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PTPRU-204ENST00000428026 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-204ENST00000428026 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
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PTPRU-204ENST00000428026 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.72■□□□□ 0.27
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PTPRU-204ENST00000428026 MCM6Q14566 821 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 DNAI1Q9UI46 699 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.7■□□□□ 0.26
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PTPRU-204ENST00000428026 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
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PTPRU-204ENST00000428026 TMCO5BA8MYB1 307 aa16.69■□□□□ 0.26
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PTPRU-204ENST00000428026 CCDC171Q6TFL3 1326 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 TSG101Q99816 390 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 NAPBQ9H115 298 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 SLC12A7Q9Y666 1083 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 BTG4Q9NY30 223 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA8AA7E2F4 631 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 MYZAPP0CAP1 466 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRU-204ENST00000428026 RFC4P35249 363 aa16.66■□□□□ 0.26
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