RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP12.73□□□□□ -0.376e-6■■■■□ 21.9
EFTUD2-202ENST00000426333 TSG101Q99816 390 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM107BQ9H098 131 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 ALDH1L2Q3SY69 923 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC82Q8N4S0 544 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CNNM3Q8NE01 707 aa12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 YEATS4O95619 227 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF165P49910 485 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CPLX3Q8WVH0 158 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF20AO95235 890 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC175P0C221 793 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 DNA2P51530 1060 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 IQCA1Q86XH1 822 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 FSIP1Q8NA03 581 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SKAP1Q86WV1 359 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 MKNK2Q9HBH9 465 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 HOOK3Q86VS8 718 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 TMOD2Q9NZR1 351 aa12.72□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 ANAPC15P60006 121 aa12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 MICALCLQ6ZW33 695 aa12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 MACROD2A1Z1Q3 448 aa12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 CAVIN2O95810 425 aa12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 GDPD2Q9HCC8 539 aa12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 STARD3NLO95772 234 aa12.71□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.71□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.71□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC11Q96J66 1382 aa12.71□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 UBA5Q9GZZ9 404 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC178Q5BJE1 867 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 MYZAPP0CAP1 466 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K12Q12852 859 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TNIP1Q15025 636 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 MCM10Q7L590 875 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TRERF1Q96PN7 1200 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TESK2Q96S53 571 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 POTEB2H3BUK9 544 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF213O14771 459 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa12.7□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC12A7Q9Y666 1083 aa12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 BIN1O00499 593 aa12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3C2GO75747 1445 aa12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ADCY5O95622 1261 aa12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM266Q2M3C6 531 aa12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TMC6Q7Z403 805 aa12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TAOK3Q9H2K8 898 aa12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 STX6O43752 255 aa12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CAVIN4Q5BKX8 364 aa12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP12.69□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8BA8MQT2 603 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 GOPCQ9HD26 462 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 NSD3Q9BZ95 1437 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 BAG4O95429 457 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 IDEP14735 1019 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 STX1AQ16623 288 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL40Q2TBA0 621 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 BMP2KLQ5H9B9 411 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 F6X3S4 739 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 STAMBPO95630 424 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CETN1Q12798 172 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ALS2CR12Q96Q35 445 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 ECHDC1Q9NTX5 307 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8AA7E2F4 631 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 TMCO5BA8MYB1 307 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 CCT2P78371 535 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 BICDL1Q6ZP65 573 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 NF2P35240 595 aa12.67□□□□□ -0.38
EFTUD2-202ENST00000426333 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms