RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LAMB2P55268 1798 aa11.02□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SRGNP10124 158 aa11.01□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPR1P16066 1061 aa11.01□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCIRG1Q13488 830 aa11.01□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C8orf58Q8NAV2 365 aa11.01□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NECTIN2Q92692 538 aa11.01□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.01□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADCY9O60503 1353 aa11.01□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NTSR2O95665 410 aa11□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANXA1P04083 346 aa11□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHRNA5P30532 468 aa11□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALDH1B1P30837 517 aa11□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRY2Q49AN0 593 aa11□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRIPAP1Q4V328 841 aa11□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC10A5Q5PT55 438 aa10.99□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.99□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.99□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NLRP10Q86W26 655 aa10.99□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.99□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SH3TC1Q8TE82 1336 aa10.99□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LTBP3Q9NS15 1303 aa10.99□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CACNA1SQ13698 1873 aa10.99□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCC12Q96J65 1359 aa10.99□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SBF1O95248 1867 aa10.98□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPTP24298 496 aa10.98□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NEXNQ0ZGT2 675 aa10.98□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUSD4Q5VX71 490 aa10.98□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSPYL6Q8N831 410 aa10.98□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC191Q8NCU4 936 aa10.98□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NLRP3Q96P20 1036 aa10.98□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VAMP4O75379 141 aa10.97□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KSR2Q6VAB6 950 aa10.97□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMC4Q7Z404 712 aa10.97□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRAMP1Q96RY5 1269 aa10.97□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLX4Q8IY92 1834 aa10.97□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERFEQ4G0M1 354 aa10.96□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC93Q567U6 631 aa10.96□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa10.96□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYH3P11055 1940 aa10.96□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM177BA6PVY3 158 aa10.95□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LMNB1P20700 586 aa10.95□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLFN5Q08AF3 891 aa10.95□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FLIIQ13045 1269 aa10.95□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.95□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.95□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIAM2Q8IVF5 1701 aa10.95□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PI4KAP2A4QPH2 592 aa10.94□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa10.94□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAOK3Q9H2K8 898 aa10.94□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.94□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa10.93□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDHR2Q9BYE9 1310 aa10.93□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.93□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.93□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYD88Q99836 296 aa10.93□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa10.93□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC37AA6NMS7 1700 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTPRCP08575 1304 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NFKBIEO00221 500 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C21orf2O43822 256 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BBOX1O75936 387 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALDH1L2Q3SY69 923 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9orf131Q5VYM1 1079 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MIER1Q8N108 512 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINS1Q8NG48 757 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAAF4Q8WXU2 420 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSMD1Q99460 953 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VPS33BQ9H267 617 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF181Q9P0P0 153 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNED1Q8TER0 1413 aa10.92□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KDM2BQ8NHM5 1336 aa10.91□□□□□ -0.66
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa10.91□□□□□ -0.66
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