RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 NBPF4Q96M43 638 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC39A6Q13433 755 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 EHMT1Q9H9B1 1298 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 TOP1P11387 765 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 LMBR1LQ6UX01 489 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 SPA17Q15506 151 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 MICU3Q86XE3 530 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 WDR62O43379 1518 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 POTEJP0CG39 1038 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 KAT14Q9H8E8 782 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 ADAMTS12P58397 1594 aa18.39■□□□□ 0.54
SH3BP4-203ENST00000409212 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 GSTO1P78417 241 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 UBXN4Q92575 508 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 VAMP4O75379 141 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CAVIN2O95810 425 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 NEFHP12036 1026 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CKAP2LQ8IYA6 745 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 UQCRHLA0A096LP55 91 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 HLA-DOAP06340 250 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 UQCRHP07919 91 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 PTPN14Q15678 1187 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 UBE2HP62256 183 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 TMTC2Q8N394 836 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 ABCC1P33527 1531 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 VPS36Q86VN1 386 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 BRF1Q92994 677 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 TMX3Q96JJ7 454 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 KRT23Q9C075 422 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 TOM1O60784 492 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 ST5P78524 1137 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 AMPD3Q01432 767 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 KANK3Q6NY19 840 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 TRPM2O94759 1503 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 NEMFO60524 1076 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 IL2RBP14784 551 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC191Q8NCU4 936 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CABP5Q9NP86 173 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 TBX22Q9Y458 520 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CETN2P41208 172 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP4R3AQ6IN85 833 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 GDPD2Q9HCC8 539 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 STX1AQ16623 288 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 MAP3K5Q99683 1374 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CALML4Q96GE6 196 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 NLRP3Q96P20 1036 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CNNM2Q9H8M5 875 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 ATP6V1AP38606 617 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPYL1Q9H0U9 437 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 GCP02774 474 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 WTAPQ15007 396 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 SETDB2Q96T68 719 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 EYA1Q99502 592 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 DCTPP1Q9H773 170 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 FBXO3Q9UK99 471 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A1W2PP64 1363 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 UBA7P41226 1012 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 GBP3Q9H0R5 595 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 DDB1Q16531 1140 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF18AQ8NI77 898 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 DCAF5Q96JK2 942 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF5CO60282 957 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC102BQ68D86 513 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 ESR2Q92731 530 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP4-203ENST00000409212 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms