RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 VAC14Q08AM6 782 aa10.02□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.02□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 GNASQ5JWF2 1037 aa10.01□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 A2MP01023 1474 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 STAU1O95793 577 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 PHKA2P46019 1235 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 SCNN1DP51172 638 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 MCM6Q14566 821 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 LCE3BQ5TA77 95 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 RHBDD1Q8TEB9 315 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 SIRT1Q96EB6 747 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 GPAMQ9HCL2 828 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 LRP6O75581 1613 aa10□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 MAP2K3P46734 347 aa9.99□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 WASHC4Q2M389 1173 aa9.99□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 ATP7AQ04656 1500 aa9.98□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 SYCP2Q9BX26 1530 aa9.98□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.98□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 OIP5O43482 229 aa9.98□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.98□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.98□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.98□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 GALNT6Q8NCL4 622 aa9.98□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.98□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 FMN1Q68DA7 1419 aa9.98□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 MSX1P28360 303 aa9.97□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 SOX11P35716 441 aa9.97□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 TLR1Q15399 786 aa9.97□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.97□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.97□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 TIAM1Q13009 1591 aa9.97□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.97□□□□□ -0.81
CCL20-202ENST00000409189 BTBD11A6QL63 1104 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 INHAP05111 366 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 ABL2P42684 1182 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 PHF24Q9UPV7 400 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 PZPP20742 1482 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 RUBCNLQ9H714 662 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 MIA2Q96PC5 1412 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.95□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 GDF10P55107 478 aa9.94□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 PHLPP1O60346 1717 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 NLRP1Q9C000 1473 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 JCADQ9P266 1359 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 EFHC2Q5JST6 749 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 PGBD3Q8N328 593 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 KLRG1Q96E93 195 aa9.93□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 ATP4AP20648 1035 aa9.92□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 PODNQ7Z5L7 613 aa9.92□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.92□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 DCAF5Q96JK2 942 aa9.92□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.92□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 TMEM94Q12767 1356 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 ITGB2P05107 769 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 RXRBP28702 533 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 SMTNP53814 917 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 SEMA3FQ13275 785 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 MTFR1Q15390 333 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 COG6Q9Y2V7 657 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.9□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.9□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 C2CD2LO14523 706 aa9.9□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 BNIP3LO60238 219 aa9.9□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 PROCP04070 461 aa9.9□□□□□ -0.82
CCL20-202ENST00000409189 LTKP29376 864 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms