RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 CCDC6Q16204 474 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 PRDM2Q13029 1718 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 FBF1Q8TES7 1133 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 PSME1Q06323 249 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 EVI5LQ96CN4 794 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 NEK1Q96PY6 1258 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 USP26Q9BXU7 913 aa11.24□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 BRF1Q92994 677 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 ECHDC1Q9NTX5 307 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 USP16Q9Y5T5 823 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 MYO1BO43795 1136 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 ZNF75DP51815 510 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 AK2P54819 239 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 AKR1B10O60218 316 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CCDC96Q2M329 555 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 SOGA3Q5TF21 947 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 IDH1O75874 414 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 IKQ13123 557 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 LRRC2Q9BYS8 371 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 NDUFAB1O14561 156 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CLGNO14967 610 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 NOP2P46087 812 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 ANKS4BQ8N8V4 417 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 GUCA1BQ9UMX6 200 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 RTL1A6NKG5 1358 aa11.22□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 TUBB4BP68371 445 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 VPS36Q86VN1 386 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 POTEDQ86YR6 584 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 MEIS3Q99687 375 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 CBX8Q9HC52 389 aa11.21□□□□□ -0.61
HERC3-202ENST00000402738 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CEP63Q96MT8 703 aa11.21□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.21□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 KIF5BP33176 963 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 MBIPQ9NS73 344 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 PTPRCP08575 1304 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA8AA7E2F4 631 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 TUBBP07437 444 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CEP83Q9Y592 693 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 NEBLO76041 1014 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CHMP4BP1P59074 171 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 AFAP1Q8N556 730 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 AIDAQ96BJ3 306 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 TSG101Q99816 390 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 TAOK3Q9H2K8 898 aa11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 AFMP43652 599 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 KANK3Q6NY19 840 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 HMG20BQ9P0W2 317 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CCDC160A6NGH7 325 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 IFT81Q8WYA0 676 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 CTAGE1Q96RT6 745 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 SELENOSQ9BQE4 189 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ATP6V1AP38606 617 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 EVA1CP58658 441 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa11.19□□□□□ -0.62
HERC3-202ENST00000402738 ARHGAP45Q92619 1136 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 381.7 ms