RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTDSP2-201ENST00000398073 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.625e-7■■■■□ 22.9
CTDSP2-201ENST00000398073 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPYL1Q9H0U9 437 aa18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2-201ENST00000398073 ERVK-7P63135 1459 aa18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2-201ENST00000398073 PTGS1P23219 599 aa18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2-201ENST00000398073 COPS6Q7L5N1 327 aa18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2-201ENST00000398073 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2-201ENST00000398073 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.94■□□□□ 0.62
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