RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 IER5Q5VY09 327 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 PTK7Q13308 1070 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 EFCC1Q9HA90 598 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM132AQ24JP5 1023 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 BHMTQ93088 406 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 FAM229AH3BQW9 127 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 RTN1Q16799 776 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 Q8N3U1 123 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 BCS1LQ9Y276 419 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 IGFBP4P22692 258 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 DPYDQ12882 1025 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 NGLY1Q96IV0 654 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 SEMA6BQ9H3T3 888 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRC-204ENST00000367379 A6NJR5 290 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 TGFBR3LH3BV60 316 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 APBA3O96018 575 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 GSX2Q9BZM3 304 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 FAM196BA6NMK8 535 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 LILRB5O75023 590 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 HINFPQ9BQA5 517 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 SLC6A14Q9UN76 642 aa10.38□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L15C9J2P7 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L10C9JJH3 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L12C9JPN9 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L11C9JVI0 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L21D6R901 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L18D6R9N7 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L22D6RA61 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L19D6RCP7 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L20D6RJB6 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 USP17L24Q0WX57 530 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 ANKMY2Q8IV38 441 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 NACC1Q96RE7 527 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.37□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 ILDR2Q71H61 639 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 ARXQ96QS3 562 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 LGR5O75473 907 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 GRIK4Q16099 956 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 CCINQ13939 588 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 VRTNQ9H8Y1 702 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 NAGPAQ9UK23 515 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRC-204ENST00000367379 A0A0A0MRY4 1105 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 WEE1P30291 646 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 INPP5BP32019 993 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 NFKB1P19838 968 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 IGFLR1Q9H665 355 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 C9orf172C9J069 976 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 ELNP15502 786 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 SELPP16109 830 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 NUDT8Q8WV74 236 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 PNMA5Q96PV4 448 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 KLK14Q9P0G3 267 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 FOXO3O43524 673 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 MAP3K6O95382 1288 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 EPB42P16452 691 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 IDH3AP50213 366 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 ADGRE1Q14246 886 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 DYRK3O43781 588 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 MYO19Q96H55 970 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 ZFATQ9P243 1243 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 DGKZQ13574 1117 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 MBTPS1Q14703 1052 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-204ENST00000367379 RAC1P63000 192 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-204ENST00000367379 PCSK7Q16549 785 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-204ENST00000367379 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-204ENST00000367379 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-204ENST00000367379 ARSDP51689 593 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-204ENST00000367379 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-204ENST00000367379 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-204ENST00000367379 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-204ENST00000367379 FRRS1LQ9P0K9 344 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-204ENST00000367379 ZBTB42B2RXF5 422 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-204ENST00000367379 MICAL2O94851 1124 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-204ENST00000367379 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms