RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 SEC24BO95487 1268 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 WWC3Q9ULE0 1092 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SZT2Q5T011 3432 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRL1O94910 1474 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 DDX11L8A8MPP1 907 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 NUDT18Q6ZVK8 323 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 FAM161BQ96MY7 647 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 AK5Q9Y6K8 562 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 RHBDL3P58872 404 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 KRT26Q7Z3Y9 468 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM87AQ8NBN3 555 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 THAP11Q96EK4 314 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 APBA2Q99767 749 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TERF2IPQ9NYB0 399 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 WASLO00401 505 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF394Q53GI3 561 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 STAG2Q8N3U4 1231 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 DMRTB1Q96MA1 342 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SENP7Q9BQF6 1050 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 CHST12Q9NRB3 414 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM260Q9NX78 707 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PRR12Q9ULL5 1215 aa3.44□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 FOXK2Q01167 660 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 EVX2Q03828 476 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF654Q8IZM8 581 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SLC39A7Q92504 469 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 DCBLD2Q96PD2 775 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 MLH3Q9UHC1 1453 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 CUBNO60494 3623 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 KIF1BO60333 1816 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TSPOAP1O95153 1857 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF76P36508 570 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 UBE4AQ14139 1066 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SLFNL1Q499Z3 407 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 CAPN10Q9HC96 672 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ANO2Q9NQ90 1003 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ENAMQ9NRM1 1142 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRTO14522 1441 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP23Q9P227 1491 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 POTEMA6NI47 508 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 POTEGQ6S5H5 508 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD24Q8TF21 1146 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PRIMPOLQ96LW4 560 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 IER2Q9BTL4 223 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 BCL2L12Q9HB09 334 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 NWD2Q9ULI1 1742 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GUL6 1792 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TEX14Q8IWB6 1497 aa3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GLYCTKQ8IVS8 523 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SHANK3Q9BYB0 1731 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 CREB3O43889 395 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 IGFBP4P22692 258 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SLC4A3P48751 1232 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GYS2P54840 703 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ARID5AQ03989 594 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PDXDC2PQ6P474 469 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 RETREG3Q86VR2 466 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 FRMD6Q96NE9 622 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ST13P50502 369 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SEC13P55735 322 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 FGD1P98174 961 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 MTMR3Q13615 1198 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TMTC2Q8N394 836 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PPLO60437 1756 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 A6NJY4 79 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SFI1A8K8P3 1242 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms