RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.96□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 ERFEQ4G0M1 354 aa9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 COPS6Q7L5N1 327 aa9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.95□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 NTSR2O95665 410 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 PRELPP51888 382 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 PARP10Q53GL7 1025 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 SOGA3Q5TF21 947 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 SUSD4Q5VX71 490 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 CACNA1FO60840 1977 aa9.94□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 TAF1P21675 1872 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 WDR90Q96KV7 1748 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 KIF3CO14782 793 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 CRY2Q49AN0 593 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 TAOK3Q9H2K8 898 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.93□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 ALDH1B1P30837 517 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC27Q2M243 656 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC93Q567U6 631 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 HYPKQ9NX55 129 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC37AA6NMS7 1700 aa9.92□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 SNED1Q8TER0 1413 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 NLRP10Q86W26 655 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 WWC1Q8IX03 1113 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 MYH3P11055 1940 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 SCN4AP35499 1836 aa9.91□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 TCIRG1Q13488 830 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 OLFM4Q6UX06 510 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SGMS1-201ENST00000361543 IL16Q14005 1332 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 GLTPD2A6NH11 291 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 TOMM70O94826 608 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA2Q08379 1002 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 RTKN2Q8IZC4 609 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 NLRP3Q96P20 1036 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 CHMP4AQ9BY43 222 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 SPEF2Q9C093 1822 aa9.89□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 TSPYL6Q8N831 410 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF428Q96B54 188 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 RRAGCQ9HB90 399 aa9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 ABCC4O15439 1325 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 COL4A1P02462 1669 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 COL4A5P29400 1685 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 APLP1P51693 650 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 SYNE4Q8N205 404 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 PSMD1Q99460 953 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 LTBP1Q14766 1721 aa9.87□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.86□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 SLC51AQ86UW1 340 aa9.86□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 FAM89AQ96GI7 184 aa9.86□□□□□ -0.83
SGMS1-201ENST00000361543 STK31Q9BXU1 1019 aa9.86□□□□□ -0.83
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