RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 CDCA7LQ96GN5 454 aa34.72■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 STYK1Q6J9G0 422 aa34.71■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 MASTLQ96GX5 879 aa34.71■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa34.71■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 SLC4A2P04920 1241 aa34.7■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 CHMP4AQ9BY43 222 aa34.7■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 RIC1Q4ADV7 1423 aa34.69■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa34.69■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa34.69■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 ADCY9O60503 1353 aa34.67■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 SLFN5Q08AF3 891 aa34.67■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 CRY2Q49AN0 593 aa34.67■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 MYD88Q99836 296 aa34.67■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 CHD4Q14839 1912 aa34.66■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 E9PSI1 815 aa34.66■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 NPR1P16066 1061 aa34.66■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 C21orf2O43822 256 aa34.65■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 CNKSR1Q969H4 720 aa34.65■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa34.65■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 RASSF7Q02833 373 aa34.64■■■■□ 3.14
TPGS1-201ENST00000359315 PI4KAP2A4QPH2 592 aa34.63■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 DDX58O95786 925 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 FLIIQ13045 1269 aa34.63■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 SLC10A5Q5PT55 438 aa34.63■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa34.63■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.62■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 SH3TC1Q8TE82 1336 aa34.62■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 KSR2Q6VAB6 950 aa34.62■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 FAM89AQ96GI7 184 aa34.61■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 NFKBIEO00221 500 aa34.6■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 PRELPP51888 382 aa34.6■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 SLC51AQ86UW1 340 aa34.6■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 SLX4Q8IY92 1834 aa34.6■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 OLFM4Q6UX06 510 aa34.59■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 C7orf43Q8WVR3 580 aa34.58■■■■□ 3.13
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV5-2P06315 115 aa34.57■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP3Q96P20 1036 aa34.57■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 C9orf131Q5VYM1 1079 aa34.56■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC191Q8NCU4 936 aa34.53■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 CACNA1SQ13698 1873 aa34.52■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 RNF181Q9P0P0 153 aa34.52■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 ALDH1B1P30837 517 aa34.51■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP34.51■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
TPGS1-201ENST00000359315 F6X3S4 739 aa34.5■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 CRAMP1Q96RY5 1269 aa34.5■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 DNAAF4Q8WXU2 420 aa34.49■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 ABCC4O15439 1325 aa34.49■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 NEURL1BA8MQ27 555 aa34.48■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 NEXNQ0ZGT2 675 aa34.47■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC93Q567U6 631 aa34.47■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 SNED1Q8TER0 1413 aa34.47■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 LAMB2P55268 1798 aa34.46■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 SSH1Q8WYL5 1049 aa34.46■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 BCL2L13Q9BXK5 485 aa34.46■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 LMNB1P20700 586 aa34.45■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 TAOK3Q9H2K8 898 aa34.45■■■■□ 3.11
TPGS1-201ENST00000359315 SOGA3Q5TF21 947 aa34.44■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 COL4A1P02462 1669 aa34.44■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 LTBP3Q9NS15 1303 aa34.43■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa34.41■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 GCKRQ14397 625 aa34.4■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 LINS1Q8NG48 757 aa34.4■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 CDHR2Q9BYE9 1310 aa34.39■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 GRAPQ13588 217 aa34.39■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 BEND3Q5T5X7 828 aa34.39■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
TPGS1-201ENST00000359315 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP34.38■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 SBF1O95248 1867 aa34.37■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa34.37■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 H7C1W4 665 aa34.36■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 PDE8AO60658 829 aa34.36■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 RTKN2Q8IZC4 609 aa34.36■■■■□ 3.09
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
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