RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 SSH3Q8TE77 659 aa22.3■■□□□ 1.16
PRPF39-201ENST00000355765 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
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PRPF39-201ENST00000355765 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.3■■□□□ 1.16
PRPF39-201ENST00000355765 ALKQ9UM73 1620 aa22.29■■□□□ 1.16
PRPF39-201ENST00000355765 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.29■■□□□ 1.16
PRPF39-201ENST00000355765 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRPF39-201ENST00000355765 SRGAP3O43295 1099 aa22.29■■□□□ 1.16
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PRPF39-201ENST00000355765 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRPF39-201ENST00000355765 IQCB1Q15051 598 aa22.27■■□□□ 1.16
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PRPF39-201ENST00000355765 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.26■■□□□ 1.15
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PRPF39-201ENST00000355765 ADCY9O60503 1353 aa22.15■■□□□ 1.14
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PRPF39-201ENST00000355765 H3BQV1 296 aa22.15■■□□□ 1.14
PRPF39-201ENST00000355765 RESTQ13127 1097 aa22.15■■□□□ 1.14
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