RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352066.7

NUP62-201, Transcript of nucleoporin 62, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP62, Length 2,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62-201ENST00000352066 GRM8O00222 908 aa14.7□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 ALDH1L1O75891 902 aa14.7□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.7□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 SUCLG2Q96I99 432 aa14.7□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 PSMA5P28066 241 aa14.69□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.69□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 KDM4AO75164 1064 aa14.69□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.69□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 RNF20Q5VTR2 975 aa14.69□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.69□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 NECTIN1Q15223 517 aa14.68□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 KRT85P78386 507 aa14.68□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 ZMYND15Q9H091 742 aa14.68□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 HIP1O00291 1037 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 SASH1O94885 1247 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 SLC39A6Q13433 755 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 MTX1Q13505 466 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 LINS1Q8NG48 757 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 GCP02774 474 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 CCDC192P0DO97 292 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 A0A0D9SFI3 127 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 SLC27A2O14975 620 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 FGD1P98174 961 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 NWD1Q149M9 1564 aa14.67□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 DYNC1I1O14576 645 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 MAP4K1Q92918 833 aa14.66□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 CACNA1FO60840 1977 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 PDCP20941 246 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 DRC7Q8IY82 874 aa14.65□□□□□ -0.06
NUP62-201ENST00000352066 TTC6Q86TZ1 520 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 TSC1Q92574 1164 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 ST3GAL1Q11201 340 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 ANKRD1Q15327 319 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 MAP3K11Q16584 847 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 SPATA32Q96LK8 384 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 ORAI2Q96SN7 254 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 MAP7D2Q96T17 732 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 MYD88Q99836 296 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 LRRC37A3O60309 1634 aa14.64□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 KAZALD1Q96I82 304 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 TNMDQ9H2S6 317 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 LIG1P18858 919 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 BICD2Q8TD16 824 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 DACT1Q9NYF0 836 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 COPS6Q7L5N1 327 aa14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 FAM177BA6PVY3 158 aa14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 H3BQV1 296 aa14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 FOSBP53539 338 aa14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 IFFO2Q5TF58 517 aa14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 DDX11Q96FC9 970 aa14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 RPS6KB1P23443 525 aa14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 LUZP1Q86V48 1076 aa14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.62□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.61□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.61□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.61□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 AP5Z1O43299 807 aa14.61□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 IGKV5-2P06315 115 aa14.61□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.61□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.6□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.6□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.6□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.6□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 TYRO3Q06418 890 aa14.6□□□□□ -0.07
NUP62-201ENST00000352066 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms