RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 KIF16BQ96L93 1317 aa34.02■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 F6X3S4 739 aa34.02■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 NUTM1Q86Y26 1132 aa34.02■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC24Q8N4L8 307 aa34.02■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 NLGN2Q8NFZ4 835 aa34.02■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 LINS1Q8NG48 757 aa34.02■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa34.01■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 IGKV5-2P06315 115 aa34.01■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 ERFEQ4G0M1 354 aa34.01■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 SH3TC1Q8TE82 1336 aa34■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP45Q92619 1136 aa34■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 BCAR3O75815 825 aa33.99■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 SLC10A5Q5PT55 438 aa33.99■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0G2JLW4 131 aa33.98■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 NEURL1BA8MQ27 555 aa33.98■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 H0YIN7 160 aa33.98■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 DPEP1P16444 411 aa33.97■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 BEND3Q5T5X7 828 aa33.97■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 SLC4A10Q6U841 1118 aa33.97■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa33.95■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 PXDNLA1KZ92 1463 aa33.95■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 C2CD5Q86YS7 1000 aa33.95■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 FAM89AQ96GI7 184 aa33.95■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 RIC1Q4ADV7 1423 aa33.95■■■■□ 3.03
CRIP1-201ENST00000330233 ALDH1L1O75891 902 aa33.93■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 GCKRQ14397 625 aa33.93■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 NLRP3Q96P20 1036 aa33.93■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa33.93■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 KCNA3P22001 575 aa33.92■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 CHRNA5P30532 468 aa33.92■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 PIM2Q9P1W9 311 aa33.92■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 ABCC12Q96J65 1359 aa33.92■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 SYNE4Q8N205 404 aa33.91■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 RCAN3Q9UKA8 241 aa33.91■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 DCAF8L1A6NGE4 600 aa33.9■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 DLEC1Q9Y238 1755 aa33.9■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 SRGNP10124 158 aa33.89■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 MASTLQ96GX5 879 aa33.89■■■■□ 3.02
CRIP1-201ENST00000330233 H7C1W4 665 aa33.88■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa33.88■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 CRY2Q49AN0 593 aa33.87■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 STYK1Q6J9G0 422 aa33.87■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa33.87■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 NPR1P16066 1061 aa33.86■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP33.86■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 CDHR2Q9BYE9 1310 aa33.86■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 CCT4P50991 539 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 CNKSR1Q969H4 720 aa33.84■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 LAMB2P55268 1798 aa33.83■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 GPR162Q16538 588 aa33.83■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa33.83■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 TTLL6Q8N841 843 aa33.83■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 PDE8AO60658 829 aa33.82■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM27P14373 513 aa33.82■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 ALDH1B1P30837 517 aa33.82■■■■□ 3.01
CRIP1-201ENST00000330233 MYH3P11055 1940 aa33.82■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 GRM8O00222 908 aa33.81■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 C3orf67Q6ZVT6 689 aa33.8■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 BCS1LQ9Y276 419 aa33.79■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 ABCC4O15439 1325 aa33.79■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 CASP7P55210 303 aa33.79■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 WWC3Q9ULE0 1092 aa33.79■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa33.78■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 CRAMP1Q96RY5 1269 aa33.78■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 PLA2G12BQ9BX93 195 aa33.77■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 CACNA1SQ13698 1873 aa33.76■■■■□ 3
CRIP1-201ENST00000330233 UTYO14607 1347 aa33.76■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 GRIN3BO60391 1043 aa33.76■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 MS4A1P11836 297 aa33.76■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 CLUAP1Q96AJ1 413 aa33.76■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 SLX4Q8IY92 1834 aa33.75■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP33.75■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC152Q4G0S7 254 aa33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms