RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298818.12

ISCA2-201, Transcript of iron-sulfur cluster assembly 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ISCA2, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISCA2-201ENST00000298818 ZNF853P0CG23 659 aa22.56■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 APLP1P51693 650 aa22.56■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 CCDC93Q567U6 631 aa22.56■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.56■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 ALDH1B1P30837 517 aa22.55■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 FSTL1Q12841 308 aa22.55■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 SOGA3Q5TF21 947 aa22.55■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 SYNE4Q8N205 404 aa22.55■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 CFAP44Q96MT7 982 aa22.55■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 MBIPQ9NS73 344 aa22.55■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 SCN4AP35499 1836 aa22.54■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.53■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.53■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 ZNF428Q96B54 188 aa22.53■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 NLRP10Q86W26 655 aa22.52■■□□□ 1.2
ISCA2-201ENST00000298818 POTEIP0CG38 1075 aa22.51■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 POTEJP0CG39 1038 aa22.51■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 PARP10Q53GL7 1025 aa22.51■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.51■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.51■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 COL4A1P02462 1669 aa22.5■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 TCIRG1Q13488 830 aa22.5■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.5■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.5■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.5■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.5■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 HOXB7P09629 217 aa22.49■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.49■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 PCNTO95613 3336 aa22.49■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 LTBP1Q14766 1721 aa22.48■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.48■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 PSMD1Q99460 953 aa22.47■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 FZD9O00144 591 aa22.46■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 NLRP3Q96P20 1036 aa22.46■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 IFT57Q9NWB7 429 aa22.46■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ISCA2-201ENST00000298818 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.45■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.45■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.45■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.45■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 ABCC4O15439 1325 aa22.45■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.44■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.43■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.43■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.42■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 GNAI1P63096 354 aa22.42■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.42■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 TSPYL6Q8N831 410 aa22.42■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 KLRG1Q96E93 195 aa22.41■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 HYPKQ9NX55 129 aa22.41■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.41■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.4■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 FAM89AQ96GI7 184 aa22.4■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.39■■□□□ 1.18
ISCA2-201ENST00000298818 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 CHADLQ6NUI6 762 aa22.39■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 JMYQ8N9B5 988 aa22.38■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 WWC1Q8IX03 1113 aa22.36■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 SP8Q8IXZ3 490 aa22.36■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 GPC2Q8N158 579 aa22.36■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.35■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 BBOX1O75936 387 aa22.35■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 AOC3Q16853 763 aa22.35■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 CCDC27Q2M243 656 aa22.35■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.35■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.35■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 JDP2Q8WYK2 163 aa22.35■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 PASKQ96RG2 1323 aa22.34■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 EPHX2P34913 555 aa22.34■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 GRAPQ13588 217 aa22.34■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 HACL1Q9UJ83 578 aa22.34■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 SCNN1DP51172 638 aa22.33■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
ISCA2-201ENST00000298818 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.5 ms