RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 SSH3Q8TE77 659 aa22.28■■□□□ 1.16
CNOT11-201ENST00000289382 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CNOT11-201ENST00000289382 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CNOT11-201ENST00000289382 HYPKQ9NX55 129 aa22.27■■□□□ 1.16
CNOT11-201ENST00000289382 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.27■■□□□ 1.16
CNOT11-201ENST00000289382 TERF2Q15554 542 aa22.27■■□□□ 1.16
CNOT11-201ENST00000289382 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.27■■□□□ 1.16
CNOT11-201ENST00000289382 CBX8Q9HC52 389 aa22.27■■□□□ 1.16
CNOT11-201ENST00000289382 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 TRIM5Q9C035 493 aa22.26■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF75DP51815 510 aa22.26■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.26■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.26■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 KRT222Q8N1A0 295 aa22.26■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 LIG1P18858 919 aa22.25■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.25■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 TTC6Q86TZ1 520 aa22.25■■□□□ 1.15
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CNOT11-201ENST00000289382 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.25■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 CNTROBQ8N137 903 aa22.25■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF592Q92610 1267 aa22.24■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.24■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 BEND3Q5T5X7 828 aa22.24■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 RAB11FIP3O75154 756 aa22.23■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 IP6K1Q92551 441 aa22.23■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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CNOT11-201ENST00000289382 PTH1RQ03431 593 aa22.23■■□□□ 1.15
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CNOT11-201ENST00000289382 POLA2Q14181 598 aa22.23■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.23■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 CEP135Q66GS9 1140 aa22.23■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 TNMDQ9H2S6 317 aa22.23■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.23■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.23■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 NECAB1Q8N987 351 aa22.22■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 KRT85P78386 507 aa22.22■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.22■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 KCNJ4P48050 445 aa22.21■■□□□ 1.15
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CNOT11-201ENST00000289382 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.21■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.21■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.21■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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CNOT11-201ENST00000289382 BTBD11A6QL63 1104 aa22.21■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 PSME1Q06323 249 aa22.21■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 PDE4CQ08493 712 aa22.21■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CNOT11-201ENST00000289382 DACT1Q9NYF0 836 aa22.21■■□□□ 1.15
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CNOT11-201ENST00000289382 FERMT3Q86UX7 667 aa22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 ADCY9O60503 1353 aa22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 ME3Q16798 604 aa22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 VGLL3A8MV65 326 aa22.19■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 ELP1O95163 1332 aa22.19■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 VPS53Q5VIR6 699 aa22.19■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 ORAI2Q96SN7 254 aa22.18■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 TEFQ10587 303 aa22.18■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.17■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.17■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 USP27XA6NNY8 438 aa22.17■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.17■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.17■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF165P49910 485 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 TIGD1Q96MW7 591 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 PXDNQ92626 1479 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 CACNA1FO60840 1977 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 ERICH4A6NGS2 130 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.15■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CNOT11-201ENST00000289382 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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