RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 NLRP10Q86W26 655 aa39.54■■■■□ 3.92
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INO80B-201ENST00000233331 CCER2I3L3R5 266 aa39.52■■■■□ 3.92
INO80B-201ENST00000233331 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
INO80B-201ENST00000233331 RNF181Q9P0P0 153 aa39.5■■■■□ 3.91
INO80B-201ENST00000233331 RNF123Q5XPI4 1314 aa39.49■■■■□ 3.91
INO80B-201ENST00000233331 CRY2Q49AN0 593 aa39.49■■■■□ 3.91
INO80B-201ENST00000233331 RIC3Q7Z5B4 369 aa39.49■■■■□ 3.91
INO80B-201ENST00000233331 STK31Q9BXU1 1019 aa39.49■■■■□ 3.91
INO80B-201ENST00000233331 SBF1O95248 1867 aa39.48■■■■□ 3.91
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INO80B-201ENST00000233331 ZNF428Q96B54 188 aa39.46■■■■□ 3.91
INO80B-201ENST00000233331 ISCA1Q9BUE6 129 aa39.46■■■■□ 3.91
INO80B-201ENST00000233331 MYH16Q9H6N6 1097 aa39.46■■■■□ 3.91
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INO80B-201ENST00000233331 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa39.45■■■■□ 3.91
INO80B-201ENST00000233331 ALDH1B1P30837 517 aa39.44■■■■□ 3.9
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INO80B-201ENST00000233331 SOGA3Q5TF21 947 aa39.44■■■■□ 3.9
INO80B-201ENST00000233331 SLC10A5Q5PT55 438 aa39.43■■■■□ 3.9
INO80B-201ENST00000233331 C3orf67Q6ZVT6 689 aa39.43■■■■□ 3.9
INO80B-201ENST00000233331 NLRP3Q96P20 1036 aa39.43■■■■□ 3.9
INO80B-201ENST00000233331 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa39.43■■■■□ 3.9
INO80B-201ENST00000233331 SH3TC1Q8TE82 1336 aa39.42■■■■□ 3.9
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INO80B-201ENST00000233331 ZNF521Q96K83 1311 aa39.41■■■■□ 3.9
INO80B-201ENST00000233331 PRELPP51888 382 aa39.4■■■■□ 3.9
INO80B-201ENST00000233331 SYNE4Q8N205 404 aa39.4■■■■□ 3.9
INO80B-201ENST00000233331 C7orf43Q8WVR3 580 aa39.4■■■■□ 3.9
INO80B-201ENST00000233331 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
INO80B-201ENST00000233331 CCDC93Q567U6 631 aa39.39■■■■□ 3.9
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INO80B-201ENST00000233331 TAOK3Q9H2K8 898 aa39.39■■■■□ 3.9
INO80B-201ENST00000233331 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
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INO80B-201ENST00000233331 VAMP4O75379 141 aa39.37■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 SLC4A2P04920 1241 aa39.37■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa39.37■■■■□ 3.89
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INO80B-201ENST00000233331 LTBP3Q9NS15 1303 aa39.36■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 LAMB2P55268 1798 aa39.36■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 OLFM4Q6UX06 510 aa39.35■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 G2E3Q7L622 706 aa39.34■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 FAM89AQ96GI7 184 aa39.34■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 CRAMP1Q96RY5 1269 aa39.34■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa39.34■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 TIAM2Q8IVF5 1701 aa39.34■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 KSR2Q6VAB6 950 aa39.33■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
INO80B-201ENST00000233331 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
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INO80B-201ENST00000233331 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa39.31■■■■□ 3.88
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INO80B-201ENST00000233331 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
INO80B-201ENST00000233331 FLIIQ13045 1269 aa39.28■■■■□ 3.88
INO80B-201ENST00000233331 CCDC191Q8NCU4 936 aa39.28■■■■□ 3.88
INO80B-201ENST00000233331 ABCC4O15439 1325 aa39.28■■■■□ 3.88
INO80B-201ENST00000233331 CACNA1FO60840 1977 aa39.27■■■■□ 3.88
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INO80B-201ENST00000233331 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.87
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INO80B-201ENST00000233331 KDM2BQ8NHM5 1336 aa39.24■■■■□ 3.87
INO80B-201ENST00000233331 E9PSI1 815 aa39.24■■■■□ 3.87
INO80B-201ENST00000233331 NEXNQ0ZGT2 675 aa39.24■■■■□ 3.87
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INO80B-201ENST00000233331 C1QTNF8P60827 252 aa39.22■■■■□ 3.87
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INO80B-201ENST00000233331 KIF3CO14782 793 aa39.21■■■■□ 3.87
INO80B-201ENST00000233331 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
INO80B-201ENST00000233331 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
INO80B-201ENST00000233331 IGKV5-2P06315 115 aa39.2■■■■□ 3.87
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INO80B-201ENST00000233331 GRAPQ13588 217 aa39.18■■■■□ 3.86
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INO80B-201ENST00000233331 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
INO80B-201ENST00000233331 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
INO80B-201ENST00000233331 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
INO80B-201ENST00000233331 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
INO80B-201ENST00000233331 PSMD1Q99460 953 aa39.17■■■■□ 3.86
INO80B-201ENST00000233331 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa39.17■■■■□ 3.86
INO80B-201ENST00000233331 GLTPD2A6NH11 291 aa39.16■■■■□ 3.86
INO80B-201ENST00000233331 BBOX1O75936 387 aa39.16■■■■□ 3.86
INO80B-201ENST00000233331 GRIPAP1Q4V328 841 aa39.16■■■■□ 3.86
INO80B-201ENST00000233331 DNAAF4Q8WXU2 420 aa39.16■■■■□ 3.86
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