RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223423.8

PTGS1-201, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGS1, Length 2,328 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-201ENST00000223423 H7C1W4 665 aa15.21■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.21■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 DISP2A7MBM2 1401 aa15.21■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 AK9Q5TCS8 1911 aa15.2■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 HSPA4P34932 840 aa15.2■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 RAD50Q92878 1312 aa15.2■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 SSFA2P28290 1259 aa15.2■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 FOXO4P98177 505 aa15.2■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.19■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 EVI5LQ96CN4 794 aa15.19■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 ATG3Q9NT62 314 aa15.19■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 AFF2P51816 1311 aa15.19■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.19■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 LMBR1LQ6UX01 489 aa15.18■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.18■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 EP400Q96L91 3159 aa15.18■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 NRAPQ86VF7 1730 aa15.18■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 TFCP2Q12800 502 aa15.18■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.18■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 BOLA2Q9H3K6 86 aa15.17■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 USP21Q9UK80 565 aa15.17■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 BCL9LQ86UU0 1499 aa15.17■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 DDX11L8A8MPP1 907 aa15.17■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 TRAK2O60296 914 aa15.17■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 TMX3Q96JJ7 454 aa15.17■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.17■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 TNNI3KQ59H18 835 aa15.16■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.16■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 GBP4Q96PP9 640 aa15.16■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.16■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 TJP1Q07157 1748 aa15.16■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 PKP1Q13835 747 aa15.16■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.16■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.16■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 SNX14Q9Y5W7 946 aa15.16■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 MCM2P49736 904 aa15.15■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 PTH1RQ03431 593 aa15.15■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 RASEFQ8IZ41 740 aa15.15■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.15■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 SLIT2O94813 1529 aa15.15■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 FAM227BQ96M60 508 aa15.15■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.15■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.15■□□□□ 0.02
PTGS1-201ENST00000223423 BCL9O00512 1426 aa15.14■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 CLEC17AQ6ZS10 378 aa15.14■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 SLC4A9Q96Q91 983 aa15.14■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 FAM182BQ5T319 152 aa15.14■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 EXOC5O00471 708 aa15.13■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 NUCB2P80303 420 aa15.13■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 TCIRG1Q13488 830 aa15.13■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 CUL4AQ13619 759 aa15.13■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 ATG9AQ7Z3C6 839 aa15.13■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 ITGB4P16144 1822 aa15.13■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.12■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 STARD3NLO95772 234 aa15.12■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 ATP5JP18859 108 aa15.12■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 FSD1Q9BTV5 496 aa15.12■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.12■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 A0A0D9SFI3 127 aa15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 A0A0G2JS52 829 aa15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 HIP1O00291 1037 aa15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 TTC14Q96N46 770 aa15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 SNRKQ9NRH2 765 aa15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 CCDC171Q6TFL3 1326 aa15.11■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.1■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 NECTIN1Q15223 517 aa15.1■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 LRRC24Q50LG9 513 aa15.1■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 KCNB2Q92953 911 aa15.1■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.09■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 ARXQ96QS3 562 aa15.09■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.09■□□□□ 0.01
PTGS1-201ENST00000223423 CPA1P15085 419 aa15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms