RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 STX6O43752 255 aa26.83■■□□□ 1.89
TARBP1-201ENST00000040877 CETN2P41208 172 aa26.83■■□□□ 1.89
TARBP1-201ENST00000040877 IL2RBP14784 551 aa26.83■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.83■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 TMTC2Q8N394 836 aa26.83■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 TBX22Q9Y458 520 aa26.83■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 ATP2B3Q16720 1220 aa26.82■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 VPS36Q86VN1 386 aa26.82■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.82■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 CNNM3Q8NE01 707 aa26.82■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 AMPD3Q01432 767 aa26.82■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 KRT23Q9C075 422 aa26.82■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 ANXA1P04083 346 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 GJB2P29033 226 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 ANAPC15P60006 121 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 CCT2P78371 535 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 TRAF1Q13077 416 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 SPA17Q15506 151 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 ABCC2Q92887 1545 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 SETDB2Q96T68 719 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 CAVIN2O95810 425 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 GUCY1B3Q02153 619 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 DDB1Q16531 1140 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.81■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.8■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 NLRP3Q96P20 1036 aa26.8■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 KANK3Q6NY19 840 aa26.8■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.8■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 IGHDP01880 384 aa26.8■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 MAP3K5Q99683 1374 aa26.79■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 ATP6V1AP38606 617 aa26.79■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 FBLN1P23142 703 aa26.79■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 PDE1AP54750 535 aa26.79■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.79■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 FSIP1Q8NA03 581 aa26.79■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 TESK2Q96S53 571 aa26.79■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 ZSCAN30Q86W11 494 aa26.79■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 CALML4Q96GE6 196 aa26.79■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 DCAF5Q96JK2 942 aa26.79■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 SSFA2P28290 1259 aa26.78■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 UQCRHLA0A096LP55 91 aa26.78■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 H0YHG0 523 aa26.78■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 UQCRHP07919 91 aa26.78■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 NEFHP12036 1026 aa26.78■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.78■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 NYXQ9GZU5 481 aa26.78■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 ZMYM3Q14202 1370 aa26.77■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 BMP15O95972 392 aa26.77■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.77■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 FEZ1Q99689 392 aa26.77■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.77■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.77■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.77■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.77■■□□□ 1.88
TARBP1-201ENST00000040877 SDSP20132 328 aa26.76■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa26.76■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 MICU3Q86XE3 530 aa26.76■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 MYO1BO43795 1136 aa26.76■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 NEMFO60524 1076 aa26.76■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.75■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.75■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 MPNDQ8N594 471 aa26.75■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 ESR2Q92731 530 aa26.75■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 SLC39A6Q13433 755 aa26.75■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 GCP02774 474 aa26.74■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 WTAPQ15007 396 aa26.74■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa26.74■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 HAND2P61296 217 aa26.74■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.74■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 GBP3Q9H0R5 595 aa26.74■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.74■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 GNAQP50148 359 aa26.74■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.877e-6■■■■□ 22.7
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TARBP1-201ENST00000040877 SKIDA1Q1XH10 827 aa26.73■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 IP6K1Q92551 441 aa26.73■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 UBA7P41226 1012 aa26.73■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 CETN1Q12798 172 aa26.73■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 STX1AQ16623 288 aa26.73■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.73■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 UBXN4Q92575 508 aa26.72■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 SCLT1Q96NL6 688 aa26.72■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 A0A1W2PP64 1363 aa26.72■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 CYP7A1P22680 504 aa26.72■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 UBE2HP62256 183 aa26.72■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.72■■□□□ 1.87
TARBP1-201ENST00000040877 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
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