RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000112320.7

Spc25-202, Transcript of Kinetochore protein Spc25, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Spc25, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc25-202ENSMUST00000112320 Cyp2c67Q569X9 491 aa22.96■■□□□ 1.27
Spc25-202ENSMUST00000112320 GpkowQ56A08 488 aa22.96■■□□□ 1.27
Spc25-202ENSMUST00000112320 NexnQ7TPW1 607 aa22.96■■□□□ 1.27
Spc25-202ENSMUST00000112320 Smc4Q8CG47 1286 aa22.96■■□□□ 1.27
Spc25-202ENSMUST00000112320 Trim34bJ3QNR8 485 aa22.95■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa22.94■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Tm6sf1P58749 370 aa22.93■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa22.93■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Triml2E9PW10 424 aa22.92■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Taf1dQ9D4V4 322 aa22.92■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Tceal9Q9DD24 104 aa22.92■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Atp6v0a2P15920 856 aa22.92■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Adora1Q60612 326 aa22.92■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa22.91■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Atp8b2P98199 1209 aa22.91■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa22.91■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Camkk2Q8C078 588 aa22.91■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Znf609Q8BZ47 1413 aa22.91■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Prl3d2F6R3P9 224 aa22.9■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa22.89■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ier5O89113 308 aa22.89■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 EgfrQ01279 1210 aa22.89■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Itga6Q61739 1091 aa22.89■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Kif2cQ922S8 721 aa22.89■■□□□ 1.26
Spc25-202ENSMUST00000112320 Gm7347D3YYI9 267 aa22.88■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Speer4aF8VPX6 267 aa22.88■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 AampJ3QN89 436 aa22.88■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 EappQ5BU09 281 aa22.88■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Itgb4A2A863 1818 aa22.88■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ciapin1Q8WTY4 309 aa22.87■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Lgr5Q9Z1P4 907 aa22.87■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Psd3Q2PFD7 1037 aa22.87■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Cwc27Q3TKY6 469 aa22.87■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Jarid2Q62315 1234 aa22.87■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa22.87■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Tnnt3Q9QZ47 272 aa22.85■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 VgfQ0VGU4 617 aa22.84■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Slc38a10Q5I012 1090 aa22.84■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Pcsk7Q61139 770 aa22.84■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Srgap3Q812A2 1099 aa22.83■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa22.83■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Adarb2Q9JI20 745 aa22.83■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Myo3bQ1EG27 1305 aa22.83■■□□□ 1.25
Spc25-202ENSMUST00000112320 Rps8P62242 208 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Fam13aQ8BGI4 693 aa22.82■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa22.82■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ube4aE9Q735 1028 aa22.82■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Oas2E9Q9A9 742 aa22.82■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa22.82■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Tmem87bQ8BKU8 555 aa22.82■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Slc39a11Q8BWY7 342 aa22.82■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Map3k15A2AQW0 1331 aa22.81■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 NeflP08551 543 aa22.81■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Dok7Q18PE0 504 aa22.81■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 VeztQ3ZK22 780 aa22.81■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 UvssaQ9D479 717 aa22.81■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Heg1E9Q7X6 1337 aa22.8■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Gpr182P43142 395 aa22.8■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Kcnh8P59111 1102 aa22.8■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Atp2b4Q6Q477 1205 aa22.8■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Popdc2Q9ES82 367 aa22.8■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Zfp831A2ADM8 1628 aa22.79■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Bin2D3Z6Q9 489 aa22.78■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Egfem1Q8C088 590 aa22.78■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Q8C5K5 320 aa22.78■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 WaslQ91YD9 501 aa22.78■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Dydc2Q9D3X8 139 aa22.78■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Naa16Q9DBB4 864 aa22.78■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Rlbp1Q9Z275 317 aa22.78■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 1700029H14RikE9PY36 240 aa22.77■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Mmp8O70138 465 aa22.77■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Sult6b1P0CC03 303 aa22.77■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Cyp2c69E9PXC3 491 aa22.77■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Klrk1O54709 232 aa22.77■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Cyp2c40P56657 491 aa22.77■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Atg9aQ68FE2 551 aa22.77■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 HlfQ8BW74 295 aa22.77■■□□□ 1.24
Spc25-202ENSMUST00000112320 Col3a1P08121 1464 aa22.76■■□□□ 1.23
Spc25-202ENSMUST00000112320 Eya2O08575 532 aa22.76■■□□□ 1.23
Spc25-202ENSMUST00000112320 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ftl2P49945 183 aa22.76■■□□□ 1.23
Spc25-202ENSMUST00000112320 PrimpolQ6P1E7 537 aa22.76■■□□□ 1.23
Spc25-202ENSMUST00000112320 Dhx38Q80X98 1228 aa22.76■■□□□ 1.23
Spc25-202ENSMUST00000112320 Plcd4Q8K3R3 807 aa22.76■■□□□ 1.23
Spc25-202ENSMUST00000112320 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Spc25-202ENSMUST00000112320 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13 ms