RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000043498.7

Hdac3-201, Transcript of Histone deacetylase 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hdac3, Length 2,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac3-201ENSMUST00000043498 VgfQ0VGU4 617 aa28.68■■■□□ 2.18
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mmp8O70138 465 aa28.67■■■□□ 2.18
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Nphp1Q9QY53 687 aa28.67■■■□□ 2.18
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Prl3d2F6R3P9 224 aa28.67■■■□□ 2.18
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cct4P80315 539 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gpr150Q8BL07 427 aa28.65■■■□□ 2.18
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
Hdac3-201ENSMUST00000043498 StrcQ8VIM6 1809 aa28.65■■■□□ 2.18
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lrp5Q91VN0 1614 aa28.64■■■□□ 2.18
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Eva1cP58659 440 aa28.64■■■□□ 2.18
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Hs1bp3Q3TC93 395 aa28.64■■■□□ 2.18
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tmem87bQ8BKU8 555 aa28.64■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa28.63■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 St5Q924W7 1134 aa28.62■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Itga6Q61739 1091 aa28.62■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Q8C5K5 320 aa28.62■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gja10Q9WUS4 505 aa28.62■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ambra1A2AH22 1300 aa28.62■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa28.6■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Wwc1Q5SXA9 1104 aa28.6■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Chmp3Q9CQ10 224 aa28.6■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 EappQ5BU09 281 aa28.59■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa28.59■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Mcmdc2E9Q956 681 aa28.59■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 AppP12023 770 aa28.59■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 SkilQ60665 675 aa28.58■■■□□ 2.17
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Aknad1E9Q8N6 675 aa28.57■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dhx38Q80X98 1228 aa28.57■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Zbtb3Q91X45 518 aa28.57■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Strip1Q8C079 837 aa28.56■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Atl3Q91YH5 541 aa28.56■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Kif2cQ922S8 721 aa28.56■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 FanclQ9CR14 375 aa28.56■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa28.55■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 LratQ9JI60 231 aa28.55■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Col4a5Q63ZW6 1691 aa28.55■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Abcc4E9Q236 1325 aa28.55■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sult6b1P0CC03 303 aa28.55■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ets1P27577 440 aa28.55■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 VeztQ3ZK22 780 aa28.54■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gm7347D3YYI9 267 aa28.53■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Speer4aF8VPX6 267 aa28.53■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 En2P09066 324 aa28.53■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Slc4a3P16283 1227 aa28.53■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Slc38a10Q5I012 1090 aa28.52■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa28.51■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Eya2O08575 532 aa28.51■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 LifrP42703 1092 aa28.51■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gpr182P43142 395 aa28.51■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Atg9aQ68FE2 551 aa28.51■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Atg4aQ8C9S8 396 aa28.51■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Gja5Q01231 358 aa28.5■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ftl2P49945 183 aa28.49■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Q8C6G1 249 aa28.48■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Aldh8a1Q8BH00 487 aa28.48■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Kcnq2Q9Z351 759 aa28.48■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Znf609Q8BZ47 1413 aa28.48■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Bin2D3Z6Q9 489 aa28.47■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa28.47■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ciao1Q99KN2 339 aa28.47■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Lgr5Q9Z1P4 907 aa28.47■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa28.47■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Chmp5Q9D7S9 219 aa28.47■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Popdc2Q9ES82 367 aa28.47■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Magea1O89006 320 aa28.46■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Magea5O89009 320 aa28.46■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Atp6v0a2P15920 856 aa28.46■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Slc39a11Q8BWY7 342 aa28.46■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tmc2Q8R4P4 888 aa28.46■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Dbr1Q923B1 550 aa28.46■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Adarb2Q9JI20 745 aa28.46■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Magea2Q9R2A2 320 aa28.46■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ube4aE9Q735 1028 aa28.45■■■□□ 2.15
Hdac3-201ENSMUST00000043498 1700029H14RikE9PY36 240 aa28.45■■■□□ 2.14
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Plcd4Q8K3R3 807 aa28.45■■■□□ 2.14
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Plekho1Q9JIY0 408 aa28.45■■■□□ 2.14
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Ppm1fQ8CGA0 452 aa28.44■■■□□ 2.14
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Rps8P62242 208 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Tango6Q8C3S2 1079 aa28.43■■■□□ 2.14
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Supt16hQ920B9 1047 aa28.43■■■□□ 2.14
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Myo3bQ1EG27 1305 aa28.43■■■□□ 2.14
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Brpf1B2RRD7 1212 aa28.43■■■□□ 2.14
Hdac3-201ENSMUST00000043498 Cfap70D3YVL2 1141 aa28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12 ms