RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 FFAR1O14842 300 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP12AP54707 1039 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF11Q15544 211 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NPTX1Q15818 432 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 DEF8Q6ZN54 512 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TP53INP1Q96A56 240 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPBAP1Q96EW2 488 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TCFL5Q9UL49 500 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP11P24347 488 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGDIAP52565 204 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGA2P52926 109 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 SPIBQ01892 262 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 DAG1Q14118 895 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PDZK1Q5T2W1 519 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP4Z1Q86W10 505 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8K3Q8NH51 312 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NUBPLQ8TB37 319 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 OSBPL10Q9BXB5 764 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ACER3Q9NUN7 267 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NINQ8N4C6 2090 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQ72 361 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 CDHR4A6H8M9 788 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF11BO00300 401 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 DLGAP1O14490 977 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPA13P48723 471 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDH3A2P51648 485 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH12P55289 794 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PSPHP78330 225 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2R2BQ00005 443 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 GANABQ14697 944 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 MARCH9Q86YJ5 346 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NLGN4XQ8N0W4 816 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4C15Q8NGM1 316 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 DIO2Q92813 273 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 USE1Q9NZ43 259 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 A4GNTQ9UNA3 340 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC14CA4D256 554 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 FRS3O43559 492 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ALPLP05186 524 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 COX6A1P12074 109 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ACADSP16219 412 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 LIMS1P48059 325 aa22.95■■□□□ 1.26
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CAPNS1-215ENST00000628018 CMPK2Q5EBM0 449 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC34A3Q8N130 599 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4C3Q8NH37 302 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 OIT3Q8WWZ8 545 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 DHRS1Q96LJ7 313 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMC7Q9H6L4 198 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SOCS6O14544 535 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC30A4O14863 429 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN2O60636 221 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TPST2O60704 377 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 GADD45GO95257 159 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 HPRP00739 348 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 FUT4P22083 530 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKACGP22612 351 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 LCN1P31025 176 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 STAT5AP42229 794 aa22.94■■□□□ 1.26
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CAPNS1-215ENST00000628018 RPS18P62269 152 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS15P62841 145 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 GABREP78334 506 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PLAURQ03405 335 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 FGFBP1Q14512 234 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 LAPTM4AQ15012 233 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 WLSQ5T9L3 541 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 KIRREL2Q6UWL6 708 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 IMMP1LQ96LU5 166 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXD1Q9GZZ0 328 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RHCGQ9UBD6 479 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB26Q9ULW5 256 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM200CA6NKL6 621 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TERTO14746 1132 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD1O60671 282 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 UQCRBP14927 111 aa22.93■■□□□ 1.26
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