RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 VDAC3Q9Y277 283 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 GXYLT2A0PJZ3 443 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1D-16P01601 117 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 NID1P14543 1247 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP3CBP16298 524 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ECHS1P30084 290 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXA1P55317 472 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDYAQ5MJ70 313 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ELP4Q96EB1 424 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 NPAS1Q99742 590 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PRRG4Q9BZD6 226 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 DSCAMO60469 2012 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 HIVEP2P31629 2446 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 SERTM1A2A2V5 107 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PLGP00747 810 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 NTSP30990 170 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKAA2P54646 552 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PKNOX1P55347 436 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR5P85299 388 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf67Q0P5P2 114 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10D3Q8NH80 312 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 L3HYPDHQ96EM0 354 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 PLPPR2Q96GM1 343 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRG7Q96K78 797 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 FMO2Q99518 471 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM204Q9BSN7 226 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GCAP28676 217 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRA3P34903 492 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 NR1H2P55055 460 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 CTBP2P56545 445 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 KRTAP1-1Q07627 177 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 TIFABQ6ZNK6 161 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 WFDC8Q8IUA0 241 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 IFT81Q8WYA0 676 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3R3Q92569 461 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9A6Q92581 669 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTR6Q9GZN1 396 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTO2Q9H4Y5 243 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 MYNNQ9NPC7 610 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ZANQ9Y493 2812 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 HS3ST1O14792 307 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 OPN1LWP04000 364 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF17P17021 662 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 IL11P20809 199 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP5J2P56134 94 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT10Q86SR1 603 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF611Q8N823 705 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 CSPG4Q6UVK1 2322 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC151A5D8V7 595 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 CXCL13O43927 109 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 TNK1Q13470 666 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A9Q8IVM8 553 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 MID1IP1Q9NPA3 183 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 EQTNQ9NQ60 294 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 TLN2Q9Y4G6 2542 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNH1O95259 989 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF844Q08AG5 666 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GATSQ8NAP1 163 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4C3Q8NH37 302 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf14Q9HBI5 128 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 STOML1Q9UBI4 398 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PCNX3Q9H6A9 2034 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG1L2C9J202 215 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8RI6L899 631 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFSF11O14788 317 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 TMCC2O75069 709 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 CRLF1O75462 422 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX30O94993 753 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPB3Q12988 150 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 IMPG1Q17R60 797 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-211ENST00000590874 BEND4Q6ZU67 534 aa22.91■■□□□ 1.26
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