RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	DPP4	P27487	766 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	CHRNB4	P30926	498 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	S100A3	P33764	101 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	UFM1	P61960	85 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	PPP2R2A	P63151	447 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	18.23	■□□□□ 0.51	6e-7	■■■□□ 17.1
PSME3-209	ENST00000589469	CDSN	Q15517	529 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	DCST1	Q5T197	706 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF787	Q6DD87	383 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	MAVS	Q7Z434	540 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	OR2M3	Q8NG83	312 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	HHATL	Q9HCP6	504 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	RNF6	Q9Y252	685 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469		B4DXG7	233 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	ALG1L2	C9J202	215 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF195	O14628	629 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	SCN2B	O60939	215 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	IDO1	P14902	403 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	HPGD	P15428	266 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	ATP6V1C1	P21283	382 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	TBXA2R	P21731	343 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	PHC1	P78364	1004 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	AAGAB	Q6PD74	315 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	APOOL	Q6UXV4	268 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	ZAR1	Q86SH2	424 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	OR4C3	Q8NH37	302 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	TEX37	Q96LM6	180 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	SFXN2	Q96NB2	322 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	MED11	Q9P086	117 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	NCKAP5	O14513	1909 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	SCD	O00767	359 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	DIAPH2	O60879	1101 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	SASH3	O75995	380 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	UQCRC2	P22695	453 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	GFRA1	P56159	465 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	GSTA3	Q16772	222 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	DCST2	Q5T1A1	773 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	OR7D2	Q96RA2	312 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	OR52B2	Q96RD2	323 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	NIN	Q8N4C6	2090 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PSME3-209	ENST00000589469	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	DUXA	A6NLW8	204 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469		C9JVG2	144 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	NDUFB5	O43674	189 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ZIC3	O60481	467 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	HK1	P19367	917 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CHM	P24386	653 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	IL12A	P29459	219 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	DGKQ	P52824	942 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	LACC1	Q8IV20	430 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	MARK4	Q96L34	752 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC115	Q96NT0	180 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	GTF3C1	Q12789	2109 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469		A0A0G2JNJ9	132 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	UBD	O15205	165 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	SLC22A3	O75751	556 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	TGDS	O95455	350 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PSME3-209	ENST00000589469	EPPIN	O95925	133 aa		18.19	■□□□□ 0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms