RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT10Q86SR1 603 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MARCH3Q86UD3 253 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LACC1Q8IV20 430 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO30Q8TB52 745 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MGARPQ8TDB4 240 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC46Q96FV0 321 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DSN1Q9H410 356 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PTGES2Q9H7Z7 377 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MED11Q9P086 117 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 Q9UFV3 132 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TACC2O95359 2948 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DVL2O14641 736 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 UTS2O95399 124 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf47O95873 294 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 IFI6P09912 130 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 G6PDP11413 515 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 HK1P19367 917 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 BMP5P22003 454 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SSTR2P30874 369 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 EMX2Q04743 252 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MYBPHQ13203 477 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TP53BP2Q13625 1128 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 DCST1Q5T197 706 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 RAET1LQ5VY80 246 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NATD1Q8N6N6 113 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 COX18Q8N8Q8 333 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTS15Q8TE58 950 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NUDT8Q8WV74 236 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OR5P2Q8WZ92 322 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NTNG2Q96CW9 530 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CREBBPQ92793 2442 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PDZD2O15018 2839 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM120BA0PK00 339 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CD8B2A6NJW9 211 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf51A8MQB3 221 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFB5O43674 189 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 FADS1O60427 444 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ZIC3O60481 467 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 NKX2-2O95096 273 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 PSMG1O95456 288 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ANGPTL1O95841 491 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ACP2P11117 423 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 CPN1P15169 458 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 ATP6V1C1P21283 382 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 MSX1P28360 303 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 UQCRC1P31930 480 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 SOAT1P35610 550 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 TIMP3P35625 211 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-214ENST00000583153 GAS1P54826 345 aa7.55□□□□□ -1.2
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