RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
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PDPR-210ENST00000568530 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 SLC7A4O43246 635 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 SYT7O43581 403 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 SIGLEC6O43699 453 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 ATG12O94817 140 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 KITLGP21583 273 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 TACR3P29371 465 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 ZP2Q05996 745 aa8□□□□□ -1.13
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PDPR-210ENST00000568530 PTP4A2Q12974 167 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.139e-12■■■■■ 46.9
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PDPR-210ENST00000568530 SLC37A3Q8NCC5 494 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 OR1N1Q8NGS0 311 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 PBDC1Q9BVG4 233 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 SPHK2Q9NRA0 654 aa8□□□□□ -1.13
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PDPR-210ENST00000568530 EMC9Q9Y3B6 208 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 FAM159BA6NKW6 160 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 C17orf105B2RV13 164 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 DNPH1O43598 174 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 IL2RGP31785 369 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 CDKN2DP55273 166 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 ARHGAP1Q07960 439 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 RAB33AQ14088 237 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 MS4A13Q5J8X5 152 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 PLAC9Q5JTB6 97 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 CREB3L2Q70SY1 520 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 NXPE3Q969Y0 559 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 HSH2DQ96JZ2 352 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 KCTD7Q96MP8 289 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 SAMD11Q96NU1 681 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 MCHR1Q99705 422 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 RXFP3Q9NSD7 469 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 K7EPK0 472 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 PRRG2O14669 202 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 PRKXP51817 358 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 HERC3Q15034 1050 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 SLC36A3Q495N2 470 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 LBX2Q6XYB7 198 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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PDPR-210ENST00000568530 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 CHPT1Q8WUD6 406 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 ZNF347Q96SE7 839 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 MRI1Q9BV20 369 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 DMAC2Q9NW81 257 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 KIAA1456Q9P272 454 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 DCCP43146 1447 aa7.99□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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PDPR-210ENST00000568530 SCELO95171 688 aa7.99□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 PFKMP08237 780 aa7.99□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 RAB13P51153 203 aa7.99□□□□□ -1.13
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PDPR-210ENST00000568530 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.99□□□□□ -1.13
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PDPR-210ENST00000568530 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.99□□□□□ -1.13
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PDPR-210ENST00000568530 CD300LBA8K4G0 201 aa7.99□□□□□ -1.13
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PDPR-210ENST00000568530 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.99□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.99□□□□□ -1.13
PDPR-210ENST00000568530 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.99□□□□□ -1.13
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