RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GLI4	P10075	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	KIT	P10721	976 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GABRA3	P34903	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MPI	P34949	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	STAR	P49675	285 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PRKAG1	P54619	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NME5	P56597	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CLDN15	P56746	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NUP107	P57740	925 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	KCNJ2	P63252	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	EGR3	Q06889	387 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TFF3	Q07654	80 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PMPCA	Q10713	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	STX3	Q13277	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	DUSP5	Q16690	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67	6e-8	■■□□□ 12.3
MDM2-234	ENST00000546048	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MARCH3	Q86UD3	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TAGAP	Q8N103	731 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLC34A3	Q8N130	599 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PPCDC	Q96CD2	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MARK4	Q96L34	752 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TIMP4	Q99727	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CCT7	Q99832	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	DOHH	Q9BU89	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MED11	Q9P086	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NTM	Q9P121	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PSME2	Q9UL46	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CENPE	Q02224	2701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048		A0A1B0GUH1	482 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048		E9PLN8	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048		H3BQF6	201 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	AQP7	O14520	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ACOX3	O15254	700 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PDPK1	O15530	556 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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