RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 RINLQ6ZS11 566 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 DHFR2Q86XF0 187 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 PRR22Q8IZ63 422 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 EID3Q8N140 333 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 TEX19Q8NA77 164 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 POGLUT1Q8NBL1 392 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 FAM110BQ8TC76 370 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 PSMF1Q92530 271 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 FIG4Q92562 907 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 FAM173AQ9BQD7 235 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 DOHHQ9BU89 302 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM4Q9C037 500 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 LRMDAQ9H2I8 198 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 PRORYQ9H606 182 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 PIF1Q9H611 641 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 YY1AP1Q9H869 796 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SELENONQ9NZV5 590 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 MKLN1Q9UL63 735 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 AKAP13Q12802 2813 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ACACAQ13085 2346 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 FRYQ5TBA9 3013 aa8.96□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 GXYLT2A0PJZ3 443 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CFAP73A6NFT4 308 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 AGAP5A6NIR3 686 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CXCR6O00574 342 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 NME4O00746 187 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SUV39H1O43463 412 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 KIAA0513O60268 411 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TSPAN2O60636 221 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 NUDT14O95848 222 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CSTAP01040 98 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SP1P08047 785 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 PRKAR1BP31321 381 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GSK3BP49841 420 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 MVDP53602 400 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 FBXW4P57775 412 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 PLGLB1Q02325 96 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SYPL1Q16563 259 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF766Q5HY98 468 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CCNJQ5T5M9 372 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GLYATQ6IB77 296 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF550Q7Z398 422 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 OR1J4Q8NGS1 313 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 PAQR8Q8TEZ7 354 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SLC35B4Q969S0 331 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ASB9Q96DX5 294 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF597Q96LX8 424 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 NSMCE2Q96MF7 247 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF583Q96ND8 569 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 UGT2B28Q9BY64 529 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CMTM6Q9NX76 183 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM200CA6NKL6 621 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ALG1L2C9J202 215 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 GSC2O15499 205 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF264O43296 627 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 ICOSLGO75144 302 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 UGT2B11O75310 529 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 CBR3O75828 277 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 RASAL1O95294 804 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-210ENST00000486889 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms